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Enregistrement W4382517111 · doi:10.1101/2023.06.26.546641

Porous membrane electrical cell-substrate impedance spectroscopy for versatile assessment of biological barriers in vitro

2023· preprint· en· W4382517111 sur OpenAlexafffund
Oleg Chebotarev, Alisa Ugodnikov, Craig A. Simmons

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
Thématique3D Printing in Biomedical Research
Établissements canadiensTed Rogers Centre for Heart ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of TorontoQuébec Consortium for Drug Discovery
Mots-clésMembraneMaterials scienceBarrier functionPermeability (electromagnetism)Substrate (aquarium)BiophysicsNanotechnologyBiocompatibilityDielectric spectroscopyChemistryElectrodeCell biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cell culture models of endothelial and epithelial barriers typically use porous membrane inserts (e.g., Transwell inserts) as a permeable substrate on which barrier cells are grown, often in co-culture with other cell types on the opposite side of the membrane. Current methods to characterize barrier function in porous membrane inserts can disrupt the barrier or provide bulk measurements that cannot isolate barrier cell resistance alone. Electrical cell-substrate impedance sensing (ECIS) addresses these limitations but its implementation on porous membrane inserts has been limited by costly manufacturing and low sensitivity. Here we present porous membrane ECIS (PM-ECIS), a cost-effective method to adapt ECIS technology to porous substrate-based in vitro models. We demonstrate high fidelity patterning of electrodes on porous membranes that can be incorporated into well plates of a variety of sizes with excellent cell biocompatibility with mono- and co-culture set ups. PM-ECIS provided sensitive, real-time measurement of isolated changes in endothelial cell barrier impedance with cell growth and barrier disruption. Barrier function characterized by PM-ECIS resistance correlated well with permeability coefficients obtained from molecular tracer permeability assays performed on the same cultures, validating the device. Integration of ECIS into conventional porous cell culture inserts provides a versatile, sensitive, and automated alternative to current methods to measure barrier function in vitro, including molecular tracer assays and transepithelial/endothelial electrical resistance (TEER).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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