Notice bibliographique
Résumé
The field of drug discovery has been the primary driver behind the development of quantitative high throughput mass spectrometry (HTMS) over the past several decades. Only in the past few years has the throughput of mass spectrometry-based assays risen to a point to match the daily throughputs of optical plate reader technology by achieving sampling rates of one sample per second (1 Hz). It is the purpose of this manuscript to attempt to explain how this came about, not through an exhaustive review of the literature but rather by defining what the trends in the field of HTMS were over the past 40 years using specific examples to illustrate its evolution. This perspective attests to the importance of addressing as many of the bottlenecks in the overall HTMS workflow as possible so a wide variety of technologies are shown to be contributors to the solution. This includes the development of MALDI (matrix-assisted laser desorption ionization) and, in particular, atmospheric pressure ionization (API) that exhibits broad compound coverage, can be adapted to high inlet fluid flow rates, and is reliable and robust under high sample loads. High speed and parallelized chromatographic systems have played a major role and ion mobility has entered the HTMS scene as a faster alternative to some of the functions high performance liquid chromatography (HPLC) provides. Improvements to the sensitivity of mass spectrometers over time have been key to enabling HTMS systems by reducing and sometimes eliminating sample preparation requirements as a consequence of the reduction in sample volumes required to achieve biologically relevant quantitation limits. And finally, the development of a variety of low volume, contact-free fluid dispensers and means to transport and ionize these samples in the ion source indicate that routine throughputs an order of magnitude faster than one sample per second are within reach in the not-too-distant future. The historical relationship and interdependence of these various technologies as components of HTMS systems are described.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,028 | 0,021 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,004 |
| Communication savante | 0,006 | 0,009 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,008 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».