Metabolomics in Acute Kidney Injury: The Experimental Perspective
Notice bibliographique
Résumé
Acute kidney injury (AKI) affects increasing numbers of in-hospital patients in Central Europe and the USA, the prognosis remains poor. Although substantial progress has been achieved in the identification of molecular/cellular processes that induce and perpetuate AKI, more integrated pathophysiological perspectives are missing. Metabolomics enables the identification of low-molecular-weight (< 1.5 kD) substances from biological specimens such as certain types of fluid or tissue. The aim of the article was to review the literature on metabolic profiling in experimental AKI and to answer the question if metabolomics allows the integration of distinct pathophysiological events such as tubulopathy and microvasculopathy in ischemic and toxic AKI. The following databases were searched for references: PubMed, Web of Science, Cochrane Library, Scopus. The period lasted from 1940 until 2022. The following terms were utilized: "acute kidney injury" OR "acute renal failure" OR "AKI" AND "metabolomics" OR "metabolic profiling" OR "omics" AND "ischemic" OR "toxic" OR "drug-induced" OR "sepsis" OR "LPS" OR "cisplatin" OR "cardiorenal" OR "CRS" AND "mouse" OR "mice" OR "murine" OR "rats" OR "rat". Additional search terms were "cardiac surgery", "cardiopulmonary bypass", "pig", "dog", and "swine". In total, 13 studies were identified. Five studies were related to ischemic, seven studies to toxic (lipopolysaccharide (LPS), cisplatin), and one study to heat shock-associated AKI. Only one study, related to cisplatin-induced AKI, was performed as a targeted analysis. The majority of the studies identified multiple metabolic deteriorations upon ischemia/the administration of LPS or cisplatin (e.g., amino acid, glucose, lipid metabolism). Particularly, abnormalities in the lipid homeostasis were shown under almost all experimental conditions. LPS-induced AKI most likely depends on the alterations in the tryptophan metabolism. Metabolomics studies provide a deeper understanding of pathophysiological links between distinct processes that are responsible for functional impairment/structural damage in ischemic or toxic or other types of AKI.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,009 | 0,013 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».