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Enregistrement W4382776735 · doi:10.1186/s12874-023-01964-y

Use of electronic health data to identify patients with moderate-to-severe osteoarthritis of the hip and/or knee and inadequate response to pain medications

2023· review· en· W4382776735 sur OpenAlexaff
Yi Lü, Michael L. Ganz, R.L. Robinson, Anthony J. Zagar, Sandra Okala, Craig T. Hartrick, Beth Johnston, Patricia Dorling, May Slim, Sheena Thakkar, Ariel Berger

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Research Methodology · 2023
Typereview
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensDuchesnay (Canada)
Organismes subventionnairesPfizerEli Lilly and Company
Mots-clésMedicineLogistic regressionOsteoarthritisChartMachine learningMedical recordRandom forestPhysical therapyDecision treeElectronic health recordArtificial intelligenceAlgorithmHealth careComputer scienceInternal medicineStatisticsAlternative medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: No algorithms exist to identify important osteoarthritis (OA) patient subgroups (i.e., moderate-to-severe disease, inadequate response to pain treatments) in electronic healthcare data, possibly due to the complexity in defining these characteristics as well as the lack of relevant measures in these data sources. We developed and validated algorithms intended for use with claims and/or electronic medical records (EMR) to identify these patient subgroups. METHODS: We obtained claims, EMR, and chart data from two integrated delivery networks. Chart data were used to identify the presence or absence of the three relevant OA-related characteristics (OA of the hip and/or knee, moderate-to-severe disease, inadequate/intolerable response to at least two pain-related medications); the resulting classification served as the benchmark for algorithm validation. We developed two sets of case-identification algorithms: one based on a literature review and clinical input (predefined algorithms), and another using machine learning (ML) methods (logistic regression, classification and regression tree, random forest). Patient classifications based on these algorithms were compared and validated against the chart data. RESULTS: We sampled and analyzed 571 adult patients, of whom 519 had OA of hip and/or knee, 489 had moderate-to-severe OA, and 431 had inadequate response to at least two pain medications. Individual predefined algorithms had high positive predictive values (all PPVs ≥ 0.83) for identifying each of these OA characteristics, but low negative predictive values (all NPVs between 0.16-0.54) and sometimes low sensitivity; their sensitivity and specificity for identifying patients with all three characteristics was 0.95 and 0.26, respectively (NPV 0.65, PPV 0.78, accuracy 0.77). ML-derived algorithms performed better in identifying this patient subgroup (range: sensitivity 0.77-0.86, specificity 0.66-0.75, PPV 0.88-0.92, NPV 0.47-0.62, accuracy 0.75-0.83). CONCLUSIONS: Predefined algorithms adequately identified OA characteristics of interest, but more sophisticated ML-based methods better differentiated between levels of disease severity and identified patients with inadequate response to analgesics. The ML methods performed well, yielding high PPV, NPV, sensitivity, specificity, and accuracy using either claims or EMR data. Use of these algorithms may expand the ability of real-world data to address questions of interest in this underserved patient population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,081
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,098

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,081
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0110,006
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,644
Tête enseignante GPT0,589
Écart entre enseignants0,055 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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