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Enregistrement W4382933176 · doi:10.1016/j.anaerobe.2023.102755

Clostridioides difficile PCR Tcdb Cycle Threshold predicts toxin EIA positivity but not severity of infection

2023· article· en· W4382933176 sur OpenAlexafffund
Regan Mah, Kerstin Locher, Theodore S. Steiner, Aleksandra Stefanovic

Notice bibliographique

RevueAnaerobe · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalProvidence Health CareUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversity of Alberta
Mots-clésClostridioidesMedicineClostridium difficile toxin AInternal medicineClostridium difficile toxin BToxinClostridium difficilePolymerase chain reactionAntibioticsMicrobiologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Diagnosis of Clostridioides difficile Infection (CDI) entails compatible clinical presentation and laboratory findings. We evaluated real-time polymerase chain reaction (qPCR) cycle threshold (C T ) as a predictor for disease severity and TcdB enzyme immunoassay (EIA) results. Methods Inpatients or emergency department patients who tested positive for tcdB gene by PCR were evaluated. Patients’ stools underwent testing for GDH and TcdA/B by EIA. Medical health records were reviewed for demographic, clinical presentation, laboratory, treatment and outcome data. Severity of CDI was calculated using various severity score indexes. Results The median C T of cases was 32.05 ± 5.45. The optimal cut-off for predicting toxin EIA positivity and severe CDI based on chart review was 32.6 and 29.8, respectively, with the area under the receiver operator characteristics curve (AUC) of 0.74 and 0.60 respectively. Conclusion C T value was an acceptable predictor for EIA toxin but less so for clinical severity. Our study potentially supports a diagnostic algorithm including C T value to reduce the number of EIA toxin assays performed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,172
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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