Cell contacts and pericellular matrix in the Xenopus gastrula chordamesoderm
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Convergent extension of the chordamesoderm is the best-examined gastrulation movement in Xenopus. Here we study general features of cell-cell contacts in this tissue by combining depletion of adhesion factors C-cadherin, Syndecan-4, fibronectin, and hyaluronic acid, the analysis of respective contact width spectra and contact angles, and La 3+ staining of the pericellular matrix. We provide evidence that like in other gastrula tissues, cell-cell adhesion in the chordamesoderm is largely mediated by different types of pericellular matrix. Specific glycocalyx structures previously identified in Xenopus gastrula tissues are absent in chordamesoderm but other contact types like 10-20 nm wide La 3+ stained structures are present instead. Knockdown of any of the adhesion factors reduces the abundance of cell contacts but not the average relative adhesiveness of the remaining ones: a decrease of adhesiveness at low contact widths is compensated by an increase of contact widths and an increase of adhesiveness proportional to width. From the adhesiveness-width relationship, we derive a model of chordamesoderm cell adhesion that involves the interdigitation of distinct pericellular matrix units. Quantitative description of pericellular matrix deployment suggests that reduced contact abundance upon adhesion factor depletion is due to some contact types becoming non-adhesive and others being lost.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».