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Enregistrement W4383373152 · doi:10.1038/s41598-023-37977-2

Molecular determinants of epithelial mesenchymal transition in mouse placenta and trophoblast stem cell

2023· article· en· W4383373152 sur OpenAlexfundno aff
S. Jena, Shreya Das, Shreeta Chakraborty, Rupasri Ain

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCSIR - Indian Institute of Chemical BiologyHospital for Sick ChildrenCouncil of Scientific and Industrial Research, India
Mots-clésTrophoblastBiologyEpithelial–mesenchymal transitionTranscriptomePlacentationCell biologyBlastocystStem cellPlacentaCellular differentiationExtracellular matrixGene expressionGeneGeneticsEmbryogenesisEmbryoTransition (genetics)Fetus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Trophectoderm cells of the blastocyst are the precursor of the placenta that is comprised of trophoblast, endothelial and smooth muscle cells. Since trophoectoderm cells are epithelial in nature, epithelial mesenchymal transition (EMT) of trophoblast stem (TS) cells might play pivotal role in placental morphogenesis. However, the molecular regulation of EMT during placental development and trophoblast differentiation still remained elusive. In this report, we sought to identify the molecular signature that regulates EMT during placental development and TS cell differentiation in mice. On E7.5 onwards the TS cells, located in the ectoplacental cone (EPC), rapidly divide and differentiate leading to formation of placenta proper. Using a real time PCR based array of functional EMT transcriptome with RNA from mouse implantation sites (IS) on E7.5 and E9.5, it was observed that there was an overall reduction of EMT gene expression in the IS as gestation progressed from E7.5 to E9.5 albeit the levels of EMT gene expression were substantial on both days. Further validation of array results using real time PCR and western blot analysis showed significant decrease in EMT-associated genes that included (a) transcription factors (Snai2, Zeb1, Stat3 and Foxc2), (b) extracellular matrix and cell adhesion related genes (Bmp1, Itga5, Vcan and Col3A1), (c) migration and motility- associated genes (Vim, Msn and FN1) and (d) differentiation and development related genes (Wnt5b, Jag1 and Cleaved Notch-1) on E9.5. To understand whether EMT is an ongoing process during placentation, the EMT-associated signatures genes, prevalent on E 7.5 and 9.5, were analysed on E12.5, E14.5 and E17.5 of mouse placenta. Interestingly, expression of these EMT-signature proteins were significantly higher at E12.5 though substantial expressions was observed in placenta with progression of gestation from mid- to late. To evaluate whether TS cells have the potential to undergo EMT ex vivo, TS cells were subjected to EMT induction, which was confirmed using morphological analysis and marker gene expression. Induction of EMT in TS cells showed similar gene expression profile of placental EMT. These results have broad biological implications, as inadequate mesenchymal transition leading to improper trophoblast-vasculogenic mimicry leads to placental pathophysiology and pregnancy failure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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