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Enregistrement W4383499136 · doi:10.1101/2023.07.05.547787

Independent component analysis (ICA) applied to dynamic oxygen-enhanced MRI (OE-MRI) for robust functional lung imaging at 3 T

2023· preprint· en· W4383499136 sur OpenAlexaff
Sarah Needleman, Mina Kim, Jamie R. McClelland, Josephine H. Naish, Marta Tibiletti, James P.B. O’Connor, Geoff J.M. Parker

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesEngineering and Physical Sciences Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchWellcome / EPSRC Centre for Interventional and Surgical SciencesCancer Research UKManchester Biomedical Research CentreRoyal Marsden NHS Foundation Trust
Mots-clésRepeatabilityIndependent component analysisReproducibilityLungSIGNAL (programming language)Nuclear medicineSensitivity (control systems)Magnetic resonance imagingMedicineBiomedical engineeringRadiologyChemistryComputer scienceInternal medicineArtificial intelligenceChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose Dynamic lung oxygen-enhanced MRI (OE-MRI) is challenging due to the presence of confounding signals and poor signal-to-noise ratio, particularly at 3 T. We have created a robust pipeline utilizing independent component analysis (ICA) to automatically extract the oxygen-induced signal change from confounding factors to improve the accuracy and sensitivity of lung OE-MRI. Methods Dynamic OE-MRI was performed on healthy participants using a dual-echo multi- slice spoiled gradient echo sequence at 3 T and cyclical gas delivery. ICA was applied to each echo within a thoracic mask. The ICA component relating to the oxygen-enhancement signal was automatically identified using correlation analysis. The oxygen-enhancement component was reconstructed, and the percentage signal enhancement (PSE) was calculated. The lung PSE of current smokers was compared with non-smokers; scan-rescan repeatability, ICA pipeline repeatability, and reproducibility between two vendors, were assessed. Results ICA successfully extracted a consistent oxygen-enhancement component for all participants. Lung tissue and oxygenated blood displayed opposite oxygen-induced signal enhancements. A significant difference in PSE was observed between the lungs of current smokers and non-smokers. The scan-rescan repeatability, and the ICA pipeline repeatability, were good. Conclusion The developed pipeline demonstrated sensitivity to the signal enhancements of the lung tissue and oxygenated blood at 3 T. The difference in lung PSE between current smokers and non-smokers indicates a likely sensitivity to lung function alterations that may be seen in mild pathology, supporting future use of our methods in patient studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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