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Enregistrement W4383561415 · doi:10.7554/elife.85773.sa2

Author response: Mechanistic insights into robust cardiac IKs potassium channel activation by aromatic polyunsaturated fatty acid analogues

2023· peer-review· en· W4383561415 sur OpenAlexafffund
Briana M Bohannon, Jessica J. Jowais, Leif Nyberg, Vanessa Olivier-Meo, Valentina Corradi, D. Peter Tieleman, Sara I. Liin, H. Peter Larsson

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesHORIZON EUROPE European Research CouncilVetenskapsrådetNational Institutes of HealthHORIZON EUROPE Framework ProgrammeCanada Research ChairsEuropean Commission
Mots-clésPotassium channelPolyunsaturated fatty acidChemistryPotassium channel blockerFatty acidBiochemistryBiophysicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Voltage-gated potassium (K V ) channels are important regulators of cellular excitability and control action potential repolarization in the heart and brain.K V channel mutations lead to disordered cellular excitability.Loss-of-function mutations, for example, result in membrane hyperexcitability, a characteristic of epilepsy and cardiac arrhythmias.Interventions intended to restore K V channel function have strong therapeutic potential in such disorders.Polyunsaturated fatty acids (PUFAs) and PUFA analogues comprise a class of K V channel activators with potential applications in the treatment of arrhythmogenic disorders such as long QT syndrome (LQTS).LQTS is caused by a loss-of-function of the cardiac I Ks channel -a tetrameric potassium channel complex formed by K V 7.1 and associated KCNE1 protein subunits.We have discovered a set of aromatic PUFA analogues that produce robust activation of the cardiac I Ks channel, and a unique feature of these PUFA analogues is an aromatic, tyrosine head group.We determine the mechanisms through which tyrosine PUFA analogues exert strong activating effects on the I Ks channel by generating modified aromatic head groups designed to probe cation-pi interactions, hydrogen bonding, and ionic interactions.We found that tyrosine PUFA analogues do not activate the I Ks channel through cation-pi interactions, but instead do so through a combination of hydrogen bonding and ionic interactions. Editor's evaluationThis work reports important findings regarding the regulation of ion channels by polyunsaturated fatty acids (PUFAs) through the identification of novel aromatic PUFA analogs with potent effects on the IKs channels, which allow for mechanistic insights into their mode of action.The experiments are solid, combining site-directed mutagenesis, electrophysiological and pharmacological approaches to dissect the different molecular mechanisms and sites involved in the functional interactions.This work will be of broad interest to ion channel biophysicists, physiologists, and medical chemists interested in drug development for LQT syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,391

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0070,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1170,028

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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