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Enregistrement W4383874757 · doi:10.20944/preprints202307.0703.v1

Association of CYP2C9*2 Allele with Sulfonylurea-Induced Hypoglycemia in Type 2 Diabetes Mellitus Patients: A Pharmacogenetic Study in Pakistani Pashtun Population

2023· preprint· en· W4383874757 sur OpenAlexaff
Asif Jan, Muhammad Saeed, Ramzi A. Mothana, Tahir Muhammad, Naveed Rahman, Abdullah R. Alanzi, Rani Akbar

Notice bibliographique

RevuePreprints.org · 2023
Typepreprint
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesKing Saud University
Mots-clésSulfonylureaPharmacogeneticsAlleleCYP2C9PopulationHypoglycemiaType 2 Diabetes MellitusMedicineAllele frequencyInternal medicineCYP2C19GeneticsPharmacologyDiabetes mellitusGenotypeBiologyEndocrinologyGeneEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polymorphism in cytochrome P450 (CYP) 2C9 enzyme is known to cause significant inter-individual differences in drug response and occurrence of adverse drug reactions. Different alleles of the CYP2C9 gene have been identified but the notable alleles responsible for reduced enzyme activity are CYP2C9*2 and CYP2C9*3. No pharmacogenetic data is available on CYP2C9*2 and CYP2C9*3 alleles in Pakistani population. In Pakistan pharmacogenetics which examines the relationship between genetic factors and drug response, are in the early stages of development. We for the first time investigated the association between the CYP2C9 variant alleles CYP2C9*2 and CYP2C9*3 and the incidence of hypoglycemia in diabetic patients who were receiving the sulfonylurea medications. A total of n=400 individuals of Pashtun ethnicity were recruited from ten different districts of Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan to participate in the study. The study participants were divided into two distinct groups: the case group (n=200) and the control group (n=200). The case group consisted of individuals with Type 2 Diabetes Mellitus (T2DM) who were receiving sulfonylurea medications and experience hypoglycaemia with it whereas the control group included individuals with T2DM who were receiving sulfonylurea medication but did not experience sulfonylurea-induced hypoglycaemia (SIH). Blood samples were obtained from study participants following informed consent. DNA was isolated from whole blood samples using Wiz-Prep DNA extraction kit. Following DNA isolation, CYP2C9 alleles were genotyped using MassARRAY sequencing platform at centre of genomics Rehman Medical Institute (RMI). The frequency of CYP2C9*2 (low activity allele) was more frequent in the diabetic patients with sulphonylurea-induced hypoglycaemia (SIH) compared to the control group (17.5% vs. 6.0%, p=0.021). The frequency of its corresponding genotype CYP2C9*1/*2 was higher in cases compared to control group (10% vs. 6% with P=0.036), same was true for genotype CYP2C9*2/*2 (7% vs. 3.5 % with P=0.028). Logistic regression analysis evident potential association of CYP2C9*2 allele and its genotypes with SIH. When adjusted for confounding factors such age, weight, sex, daily dose of sulphonylurea and triglyceride level the association between the CYP2C9*2 allele and hypoglycemia remains consistent. Confounding factors played no role in SIH because both groups (cases and controls) were closely matched in term of age, weight, sex, mean daily dose of sulphonylurea and trigyleride levels. Our study suggests that genetic information about a patient's CYP2C9 gene/enzyme can potentially assist physicians in prescribing the most suitable and safest drug based on their genetic make-up.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,201
Tête enseignante GPT0,446
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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