Functional Characterization of Novel Lunatic Fringe Variants in Spondylocostal Dysostosis Type-III with Scoliosis
Notice bibliographique
Résumé
Scoliosis affects over four million Americans, with most cases having an idiopathic cause. Pathogenic variants in the LUNATIC FRINGE (LFNG) gene can cause spondylocostal dysostosis type-III (SCD3), which is a rare skeletal dysplasia characterized by the absence, fusion, or partial development of vertebrae and ribs. Acute restrictive lung disease and scoliosis may also be present in some cases. The variability in symptoms suggests that there may be other underlying pathological mechanisms that are yet to be discovered. We conducted an analysis of two novel LFNG variants, c.766G>A (p.G256S) and c.521G>A (p.R174H), that were observed in a patient with SCD3 phenotype and scoliosis. Characterizing these variants can help us better understand the relationship between genotype and phenotype. We assessed both variants for impaired glycosyltransferase activity, subcellular mislocalization, and aberrant pre-proprotein processing. Our results indicate that the p.G256S variant is enzymatically nonfunctional, while the p.R174H variant is functionally less effective. Both variants were correctly localized and processed. Our findings suggest that the hypomorphic variant (p.R174H) may have partially improved the patient’s stature, as evidenced by a lower arm span-to-height ratio, increased height, and more vertebrae. However, this variant did not appear to have any effect on the severity of vertebral malformations, including scoliosis. Further research is necessary to determine the extent to which variations in LFNG activity affect the presentation of SCD3.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».