<i>Rhizophagus irregularis</i>, the model fungus in arbuscular mycorrhiza research, forms dimorphic spores
Notice bibliographique
Résumé
Rhizophagus irregularis is the model species for arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) research and the most widely propagated species for commercial plant biostimulants. Using asymbiotic and symbiotic cultivation systems initiated from single spores, advanced microscopy, Sanger sequencing of the glomalin gene, and PacBio sequencing of the partial 45S rRNA gene, we show that four strains of R. irregularis produce spores of two distinct morphotypes, one corresponding to the morphotype described in the R. irregularis protologue and the other having the phenotype of R. fasciculatus. The two spore morphs are easily distinguished by spore colour, thickness of the subtending hypha, thickness of the second wall layer, lamination of the innermost layer, and the dextrinoid reaction of the two outer spore wall layers to Melzer's reagent. The glomalin gene of the two spore morphs is identical and that of the PacBio sequences of the partial SSU-ITS-LSU region (2780 bp) obtained from single spores of the R. cf fasciculatus morphotype has a median pairwise similarity of 99.8% (SD = 0.005%) to the rDNA ribotypes of R. irregularis DAOM 197198. Based on these results, we conclude that the model AMF species R. irregularis is dimorphic, which has caused taxonomic confusion in culture collections and possibly in AMF research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».