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Enregistrement W4384070005 · doi:10.1093/noajnl/vdad071.007

INTERCEPTING BRAIN METASTASES THROUGH METABOLIC VULNERABILITIES

2023· article· en· W4384070005 sur OpenAlexaff
Agata Kieliszek, Daniel Mobilio, Blessing Bassey‐Archibong, Jarrod W. Johnson, Michael Piotrowski, Najaf Aghaei, William D. Gwynne, Luis M. Escudero, Susan Chafe, Karen Zhang, Andrew T. Quaile, Dillon McKenna, Minomi Subapanditha, Elvin D. de Araujo, A Sedighi, Patrick T. Gunning, Tomáš Tokár, Chitra Venugopal, J. Rafael Montenegro-Burke, Jakob Magolan, Sheila K. Singh

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology Advances · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBrain Metastases and Treatment
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesBrain Tumor Funders' Collaborative
Mots-clésIn vivoTranscriptomePopulationMedicineCancer researchIn vitroBioinformaticsPharmacologyOncologyBiologyGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract BTFC travel award recipient Patients with brain metastases (BM) face a 90% mortality rate within one year of diagnosis because the current standard of care is mainly palliative. Our patient-derived xenograft models have successfully recapitulated all the stages of the metastatic cascade and captured a “premetastatic” population of BM cells that have just seeded the brains of mice before forming mature, clinically detectable tumors. We applied RNA sequencing of premetastatic BM cells to reveal a unique deregulated transcriptomic profile that is specific to premetastatic cells despite the tumor of origin. Subsequent Connectivity Map analysis led us to identify a tool compound that exhibits anti-BM activity in vitro, while remaining ineffective against normal brain cell controls. Follow up preclinical studies showed that treatment with this tool compound reduces the tumor burden of mice compared to placebo, while providing a significant survival advantage. Mass spectrometry-based metabolomics and CRISPR knock-out studies directly validated our tool compound’s target as a targetable therapeutic vulnerability in BM, where pharmacological and genetic perturbation of the target attenuates BM cell proliferation both in vitro and in vivo. We have now begun a large-scale medicinal chemistry campaign to develop novel, brain penetrant inhibitors of this target with drug-like pre-clinical profiles validated by our in vivo experimental models for later stage preclinical development and subsequent clinical development. This potential first-in-class anti-metastatic therapy may provide an alternative treatment strategy for at-risk patients that are otherwise limited to palliation and could open the gate to future development of other anti-metastatic therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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