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Enregistrement W4384120674 · doi:10.1089/crispr.2023.0019

CRISPR-Cas-Based Biomonitoring for Marine Environments: Toward CRISPR RNA Design Optimization Via Deep Learning

2023· article· en· W4384120674 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe CRISPR Journal · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversidad de La FronteraAgencia Nacional de Investigación y DesarrolloMinistry of Business, Innovation and EmploymentNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésCRISPRBiomonitoringComputer scienceComputational biologyBiochemical engineeringEnvironmental scienceBiologyEcologyEngineeringGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Almost all of Earth's oceans are now impacted by multiple anthropogenic stressors, including the spread of nonindigenous species, harmful algal blooms, and pathogens. Early detection is critical to manage these stressors effectively and to protect marine systems and the ecosystem services they provide. Molecular tools have emerged as a promising solution for marine biomonitoring. One of the latest advancements involves utilizing CRISPR-Cas technology to build programmable, rapid, ultrasensitive, and specific diagnostics. CRISPR-based diagnostics (CRISPR-Dx) has the potential to allow robust, reliable, and cost-effective biomonitoring in near real time. However, several challenges must be overcome before CRISPR-Dx can be established as a mainstream tool for marine biomonitoring. A critical unmet challenge is the need to design, optimize, and experimentally validate CRISPR-Dx assays. Artificial intelligence has recently been presented as a potential approach to tackle this challenge. This perspective synthesizes recent advances in CRISPR-Dx and machine learning modeling approaches, showcasing CRISPR-Dx potential to progress as a rising molecular tool candidate for marine biomonitoring applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,960
Score d'incertitude au seuil0,870

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle