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Enregistrement W4384161714 · doi:10.1016/j.gim.2023.100938

Clinical, neuroradiological, and molecular characterization of mitochondrial threonyl-tRNA-synthetase (TARS2)-related disorder

2023· article· en· W4384161714 sur OpenAlexaff
Andrea Accogli, Sheng‐Jia Lin, Mariasavina Severino, Sung-Hoon Kim, Kevin Huang, Clarissa Rocca, Megan Landsverk, Maha S. Zaki, Almundher Al‐Maawali, Varunvenkat M. Srinivasan, Khalid Al‐Thihli, G Bradly Schaefer, Monica M. Davis, Davide Tonduti, Chiara Doneda, Lara M. Marten, Chris Mühlhausen, María Gómez, Eleonora Lamantea, Rafael Mena, Mathilde Nizon, Vincent Procaccio, Amber Begtrup, Aida Telegrafi, Hong Cui, Heidi L. Schulz, Julia Mohr, Saskia Biskup, Mariana Loos, Hilda Verónica Aráoz, Vincenzo Salpietro, Laura Davis Keppen, Manali Chitre, Cassidy Petree, Lucy Raymond, Julie Vogt, L. Sawyer, Alice A Basinger, Signe Vandal Pedersen, Toni S. Pearson, Dorothy K. Grange, Lokesh Lingappa, Paige McDunnah, Rita Horváth, Benjamin Cognè, Bertrand Isidor, Andreas Hahn, Karen W. Gripp, Seyed Mehdi Jafarnejad, Elsebet Østergaard, Carlos E. Prada, Daniele Ghezzi, Vykuntaraju K Gowda, Robert W. Taylor, Nahum Sonenberg, Henry Houlden, Marie Sissler, Gaurav K. Varshney, Reza Maroofian

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMinistero della SaluteWellcome TrustEvelyn TrustOklahoma Medical Research FoundationNational Institute for Health and Care ResearchFondazione Pierfranco e Luisa MarianiPresbyterian Health Foundation
Mots-clésTransfer RNAMitochondrial DNAMedicineChemistryBiochemistryBiologyGeneticsGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose Biallelic variants in TARS2 , encoding the mitochondrial threonyl-tRNA-synthetase, have been reported in a small group of individuals displaying a neurodevelopmental phenotype but with limited neuroradiological data and insufficient evidence for causality of the variants. Methods Exome or genome sequencing was carried out in 15 families. Clinical and neuroradiological evaluation was performed for all affected individuals, including review of 10 previously reported individuals. The pathogenicity of TARS2 variants was evaluated using in vitro assays and a zebrafish model. Results We report 18 new individuals harboring biallelic TARS2 variants. Phenotypically, these individuals show developmental delay/intellectual disability, regression, cerebellar and cerebral atrophy, basal ganglia signal alterations, hypotonia, cerebellar signs, and increased blood lactate. In vitro studies showed that variants within the TARS2 301-381 region had decreased binding to Rag GTPases, likely impairing mTORC1 activity. The zebrafish model recapitulated key features of the human phenotype and unraveled dysregulation of downstream targets of mTORC1 signaling. Functional testing of the variants confirmed the pathogenicity in a zebrafish model. Conclusion We define the clinico-radiological spectrum of TARS2 -related mitochondrial disease, unveil the likely involvement of the mTORC1 signaling pathway as a distinct molecular mechanism, and establish a TARS2 zebrafish model as an important tool to study variant pathogenicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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