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Evaluation of European-based polygenic risk score for breast cancer in Ashkenazi Jewish women in Israel
Hagai Levi, Shai Carmi, Saharon Rosset, Rinat Yerushalmi, Aviad Zick, Tamar Yablonski‐Peretz, Qin Wang, Manjeet K. Bolla, Joe Dennis, Kyriaki Michailidou, Michael Lush, Thomas U. Ahearn, Irene L. Andrulis, Hoda Anton‐Culver, Antonis C. Antoniou, Volker Arndt, Annelie Augustinsson, Päivi Auvinen, Laura Beane Freeman, Matthias W. Beckmann, Sabine Behrens, Marina Bermisheva, Clara Bodelón, Natalia Bogdanova, Stig E. Bojesen, Hermann Brenner, Helen Byers, Nicola J. Camp, Jose E. Castelao, Jenny Chang‐Claude, María‐Dolores Chirlaque, Wendy K. Chung, Christine L. Clarke, Margriet J. Collée, Sarah V. Colonna, Fergus J. Couch, Angela Cox, Simon S. Cross, Kamila Czene, Mary B. Daly, Peter Devilee, Thilo Dörk, Laure Dossus, Diana Eccles, A. Heather Eliassen, Mikael Eriksson, D. Gareth Evans, Peter A. Fasching, Olivia Fletcher, Henrik Flyger, Lin Fritschi, Marike Gabrielson, Manuela Gago-Domínguez, Montserrat García‐Closas, José Á. García-Sáenz, Jeanine M. Genkinger, Graham G. Giles, Mark S. Goldberg, Pascal Guénel, Per Hall, Ute Hamann, Wei He, Peter Hillemanns, Antoinette Hollestelle, Reiner Hoppe, John L. Hopper, Simona Jakovchevska, Anna Jakubowska, Helena Jernström, Esther M. John, Nichola Johnson, Michael E. Jones, Joseph Vijai, Rudolf Kaaks, Э. К. Хуснутдинова, Cari M. Kitahara, Stella Koutros, Vessela N. Kristensen, Allison W. Kurian, James V. Lacey, Diether Lambrechts, Loı̈c Le Marchand, Flavio Lejbkowicz, Annika Lindblom, Sibylle Loibl, Adriana Lori, Jan Lubiński, Mehdi Manoochehri, Dimitrios Mavroudis, Usha Menon, Anna Marie Mulligan, Rachel A. Murphy, Ines Nevelsteen, William G. Newman, Nadia Obi, Katie M. O’Brien, Ken Offit, Andrew F. Olshan, Dijana Plaseska‐Karanfilska, Janet E. Olson, Salvatore Panico, Tjoung‐Won Park‐Simon, Alpa V. Patel, Paolo Peterlongo, Brigitte Rack, Paolo Radice, Gad Rennert, Valerie Rhenius, Atocha Romero, Emmanouil Saloustros, Dale P. Sandler, Marjanka K. Schmidt, Lukas Schwentner, Mitul Shah, Priyanka Sharma, Jacques Simard, Melissa C. Southey, Jennifer Stone, William Tapper, Jack A. Taylor, Lauren R. Teras, Amanda E. Toland, Melissa A. Troester, Thérèse Truong, Lizet E. van der Kolk, Clarice R. Weinberg, Camilla Wendt, Xiaohong R. Yang, Wei Zheng, Argyrios Ziogas, Alison M. Dunning, Paul D.P. Pharoah, Douglas F. Easton, Shay Ben-Sachar, Naama Elefant, Ron Shamir, Ran Elkon
Notice bibliographique
RevueJournal of Medical Genetics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of British ColumbiaBC Cancer AgencyMcGill UniversityUniversity Health NetworkUniversity of TorontoRoyal Victoria HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesDivision of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer InstituteMedical Research and Materiel CommandInstitute of Cancer ResearchNational Center for Chronic Disease Prevention and Health PromotionServicio Gallego de SaludHealth and Medical Research FundGuy's and St Thomas' NHS Foundation TrustInstituto de Salud Carlos IIICancer Council Western AustraliaCancer Council NSWCancer Council VictoriaWorld Cancer Research FundMedical Research CouncilHeidelberger Zentrum für Personalisierte Onkologie Deutsches Krebsforschungszentrum In Der Helmholtz-GemeinschaftChief Scientist Office, Scottish Government Health and Social Care DirectorateManchester Biomedical Research CentreSeventh Framework ProgrammeUniversity of California, San FranciscoOulun Yliopistollinen SairaalaFreistaat SachsenDirectorate-General XII, Science, Research, and DevelopmentStockholm läns landstingUniversitätsklinikum Hamburg-EppendorfXunta de GaliciaStichting Tegen KankerGesellschaft der Freunde der Medizinischen Hochschule HannoverInstitut Gustave-RoussyMinistero dello Sviluppo EconomicoCancer Council South AustraliaKreftforeningenMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterCentre International de Recherche sur le CancerInstitut National Du CancerCenter for Agroforestry, University of MissouriOulun YliopistoNational Health and Medical Research CouncilMinistry of Education, Science and TechnologyDeutsche KrebshilfeCancer Institute NSWMedizinischen Hochschule HannoverKarolinska InstitutetAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroScottish GovernmentKWF KankerbestrijdingSyöpäsäätiöCentrum för idrottsforskningVetenskapsrådetNorges ForskningsrådStockholms Läns LandstingUniversity of WestminsterLigue Contre le CancerKuopion Yliopistollinen SairaalaCalifornia Department of Public HealthNational Research Foundation of KoreaMutuelle Générale de l'Education NationaleHellenic Health FoundationMinisterie van Volksgezondheid, Welzijn en SportAlexander von Humboldt-StiftungUniversity of Southern CaliforniaCancerfondenCancer Council TasmaniaItä-Suomen YliopistoEberhard Karls Universität TübingenAmerican Cancer SocietyCancer AustraliaRussian Foundation for Basic ResearchUniversity of CreteInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleTranscanDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekPublic Health InstituteKing's College LondonGentofte HospitalDeutsche ForschungsgemeinschaftCanadian Institutes of Health ResearchEuropean CommissionAgainst Breast CancerUniversity College LondonScottish Funding CouncilStavros Niarchos FoundationFondation de FranceUniversity of UtahBreast Cancer CampaignNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchNational Institutes of HealthDivision of Cancer Prevention, National Cancer InstituteLon V. Smith FoundationMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådNIHR Oxford Biomedical Research CentreU.S. ArmyMinistry of Science and Higher Education of the Russian FederationGenome CanadaUddannelses- og ForskningsministerietAcademy of FinlandBreast Cancer Research FoundationAgence Nationale de la RechercheCanadian Cancer SocietyWellcome TrustFondation du cancer du sein du QuébecFundación Científica Asociación Española Contra el CáncerHamburger KrebsgesellschaftCancer Research UKWorld Health OrganizationIsrael Science FoundationDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationUniversity of CaliforniaProgramme Grants for Applied ResearchRobert Bosch StiftungHuntsman Cancer FoundationNational Cancer InstituteEuropean Regional Development FundMinisterio de Sanidad, Servicios Sociales e IgualdadUniversity of CambridgeRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnOak FoundationDeutsches KrebsforschungszentrumNational Breast Cancer FoundationAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailNational Institute of Environmental Health SciencesSwedish Cancer FoundationVicHealthU.S. Department of Health and Human ServicesFonds Wetenschappelijk OnderzoekHuntsman Cancer InstituteMinisterio de Economía y CompetitividadBundesministerium für Bildung und ForschungOvarian Cancer Research FundVirginia Department of HealthSusan G. Komen for the CureCenters for Disease Control and PreventionNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésMedicineBreast cancerCohortGenome-wide association studyOncologyInternal medicineDemographyCancerSingle-nucleotide polymorphismGeneticsGenotypeBiologyGene
Résumé
OpenAlex consigne un résumé pour ce travail, mais il n'a pas pu être récupéré à l'instant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,717
Score d'incertitude au seuil0,387
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui