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Enregistrement W4384298128 · doi:10.5731/pdajpst.2021.012720

Identification of<i>Burkholderia cepacia</i>Complex by PCR: A Simple Way

2023· article· en· W4384298128 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePDA Journal of Pharmaceutical Science and Technology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensGroup Health CentreHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBurkholderiaBurkholderia cepacia complexMicrobiologyIdentification (biology)Isolation (microbiology)AgarPolymerase chain reactionBiologyComputational biologyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

United States Pharmacopeia (USP) General Chapter &lt;60&gt; for the detection of <i>Burkholderia cepacia</i> complex (Bcc) members in nonsterile products became official in December 2019. This isolation method requires confirmation of the identity of any growth found on <i>Burkholderia cepacia</i> Selective Agar (BCSA) by additional identification tests (refer to the Interpretation section). This article presents a singleplex polymerase chain reaction (PCR) method to rapidly confirm the membership of any microbial grown on BCSA (and other nutrient medium) in the Bcc group. This method is cost effective as it does not require expensive equipment or reagents; therefore, it can be easily adopted in the industry without an important investment. We validated this singleplex PCR Bcc identification method with previously published PCR primers with an expanded panel of 37 clinical and environmental Bcc isolates. The sources and repositories of these Bcc isolates include contaminated health products and medical devices, patients infected with cystic fibrosis, the National Microbiology Laboratory (NML) internal strain bank, and the American Type Culture Collection (ATCC). All 37 isolates that belong to the Bcc tested positive using our confirmatory identification method. Twenty-two negative controls including four isolates belonging to the genus <i>Burkholderia</i> tested negative as expected. Our work indicates that this singleplex PCR is an efficient confirmatory method for Bcc identification, and it can successfully supplement USP &lt;60&gt; for Bcc isolates identification found in pharmaceutical products.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,662

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,411
Écart entre enseignants0,364 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle