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Enregistrement W4384339426 · doi:10.7554/elife.86129

Structural insights into regulation of CNNM-TRPM7 divalent cation uptake by the small GTPase ARL15

2023· article· en· W4384339426 sur OpenAlexafffund
Luba Mahbub, Guennadi Kozlov, Pengyu Zong, Emma L Lee, Sandra Tetteh, Thushara Nethramangalath, Caroline Knorn, Jianning Jiang, Ashkan Shahsavan, Lixia Yue, Loren W. Runnels, Kalle Gehring

Notice bibliographique

RevueeLife · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueMagnesium in Health and Disease
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesArgonne National LaboratoryOffice of ScienceNational Institutes of HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Heart, Lung, and Blood InstituteMcGill UniversityU.S. Department of Energy
Mots-clésDivalentTRPM7ChemistryBinding siteBinding domainGTPaseBiophysicsBiochemistryTransient receptor potential channelBiologyReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cystathionine-β-synthase (CBS)-pair domain divalent metal cation transport mediators (CNNMs) are an evolutionarily conserved family of magnesium transporters. They promote efflux of Mg 2+ ions on their own and influx of divalent cations when expressed with the transient receptor potential ion channel subfamily M member 7 (TRPM7). Recently, ADP-ribosylation factor-like GTPase 15 (ARL15) has been identified as CNNM-binding partner and an inhibitor of divalent cation influx by TRPM7. Here, we characterize ARL15 as a GTP and CNNM-binding protein and demonstrate that ARL15 also inhibits CNNM2 Mg 2+ efflux. The crystal structure of a complex between ARL15 and CNNM2 CBS-pair domain reveals the molecular basis for binding and allowed the identification of mutations that specifically block binding. A binding deficient ARL15 mutant, R95A, failed to inhibit CNNM and TRPM7 transport of Mg 2+ and Zn 2+ ions. Structural analysis and binding experiments with phosphatase of regenerating liver 2 (PRL2 or PTP4A2) showed that ARL15 and PRLs compete for binding CNNM to coordinate regulation of ion transport by CNNM and TRPM7.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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