Methods to Characterise Enzyme Kinetics with Biological and Medicinal Substrates: The Case of Alkaline Phosphatase
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Alkaline phosphatase (AP) enzymes are of broad interest in fields ranging from biochemistry and medicine to biotechnology and nanotechnology. Characterising the catalytic activity of AP is typically realised by either employing non‐natural signal‐generating substrates that are detectable by absorbance and fluorescence spectroscopy or by quantifying the release of inorganic phosphate by the classic malachite green assay. The latter method is often required for studying “spectroscopically silent” biomolecular substrates, but it does not enable continuous monitoring of kinetics in real‐time. In recent years, newer techniques for studying AP function have been developed to circumvent this limitation, including fluorescent and colourimetric substrate‐specific assays based on supramolecular chemistry, organic probes and nanomaterials, as well as other assays based on isothermal titration calorimetry, direct detection with infrared spectroscopy and mass spectrometry, and monitoring conformational change by fluorescent nanoantennas. Here, we review these strategies and comment on their strengths and weaknesses in the context of AP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».