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Enregistrement W4384560866 · doi:10.21203/rs.3.rs-3134880/v1

Clinical and molecular profile of 17 patients with DOCK8 deficiency: A single-centre experience from Southern India

2023· preprint· en· W4384560866 sur OpenAlexaff
Neha Singh, Jyothi Janardhanan, Priya Ranganath, Rachna Shanbhag Mohite, Chetan Ginigeri, Harish Kumar, Sagar Bhattad

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensASTER
Organismes subventionnairesJeffrey Modell Foundation
Mots-clésMedicinePrimary immunodeficiencyX-linked agammaglobulinemiaImmunodeficiencyBronchiectasisAlopecia areataDermatologyPediatricsImmunologyInternal medicineImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction DOCK8 deficiency is the most common cause of autosomal recessive Hyper IgE syndrome (AR-HIES). The clinical spectrum is wide resulting in combined immunodeficiency, atopy, autoimmunity, and malignancies. Objectives To study the clinical and molecular profile of 17 patients with DOCK8 deficiency. Methods Three hundred sixty patients with various Inborn errors of Immunity (IEIs) were diagnosed in the Pediatric Immunology Unit of our hospital during the study period of February 2017 to April 2023. Based on the clinical and immunological phenotype, DOCK8 deficiency was suspected in 21 patients. Genetic studies confirmed DOCK8 deficiency in 17 patients and their profile was analysed in detail. Results Seventeen patients from 14 kindreds were diagnosed with DOCK8 deficiency. Thirteen of these families (92%) reported consanguinity. Our cohort had eight male and nine females. The mean age at onset of symptoms and diagnosis was seven months and 5.8 years respectively. Eczema was noted in 16 patients. Mucocutaneous manifestations included oromucosal hyperpigmentation(n=6), scalp seborrhoea(n=2), alopecia(n=1) and perianal tag(n=1). The spectrum of infections included pneumonia(n=11), diarrhea (n=5), otitis media (n=4), mucocutaneous candidiasis(n=3),meningoencephalitis(n=2), and cutaneous viral infections (n=3). Two patients had developed bronchiectasis. Autoimmune manifestations were noted in four patients and included autoimmune haemolytic anaemia (n=2) and vasculitis (n=2). Single exonic deletions(n=10) in DOCK8 gene were the most common mutations observed and 13 of these were novel. Twelve patients were on monthly intravenous immunoglobulin therapy at the time of writing this paper. Three patients underwent hematopoietic stem cell transplants elsewhere, two of whom succumbed to post-transplant complications and one is doing well. Overall, eight patients died during the study period, while nine patients continue to remain on follow-up. Conclusion We present one of the largest single-centre experiences on DOCK8 deficiency from India. A significant delay in the diagnosis contributed to poor outcome in our cohort.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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