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Enregistrement W4384561507 · doi:10.1038/s42256-023-00652-2

Federated benchmarking of medical artificial intelligence with MedPerf

2023· article· en· W4384561507 sur OpenAlexaff
Alexandros Karargyris, Renato Umeton, Micah Sheller, Alejandro Aristizábal, Johnu George, Anna Wuest, Sarthak Pati, Hasan Kassem, Maximilian Zenk, Ujjwal Baid, Prakash Narayana Moorthy, Alexander Chowdhury, Junyi Guo, Sahil Nalawade, Jacob Rosenthal, David Kanter, Maria Xenochristou, Daniel J. Beutel, Verena Chung, Timothy Bergquist, James A. Eddy, Abubakar Abid, Lewis Tunstall, Omar Sanseviero, Dimitrios Dimitriadis, Yiming Qian, Xinxing Xu, Yong Liu, Rick Siow Mong Goh, Srini Bala, Victor Bittorf, Sreekar Reddy Puchala, Biagio Ricciuti, Soujanya Samineni, Eshna Sengupta, Akshay Chaudhari, Cody Coleman, Bala Desinghu, Gregory Diamos, Debo Dutta, Diane Feddema, Grigori Fursin, Xinyuan Huang, Satyananda Kashyap, Nicholas D. Lane, Indranil Mallick, Pietro Mascagni, Virendra Mehta, Cassiano Ferro Moraes, Vivek Natarajan, Nikola S. Nikolov, Nicolas Padoy, Gennady Pekhimenko, Vijay Janapa Reddi, G. Anthony Reina, Pablo Ribalta, Abhishek Singh, Jayaraman J. Thiagarajan, Jacob Albrecht, Thomas Wolf, Geralyn M. Miller, Huazhu Fu, Prashant Shah, Daguang Xu, Poonam Yadav, David Talby, Mark M. Awad, Jeremy P. Howard, Michael H. Rosenthal, Luigi Marchionni, Massimo Loda, Jason M. Johnson, Spyridon Bakas, Peter Mattson

Notice bibliographique

RevueNature Machine Intelligence · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueArtificial Intelligence in Healthcare and Education
Établissements canadiensVector InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthAgence Nationale de la RechercheNational Cancer InstituteNational Research Foundation SingaporeNational Research Foundation
Mots-clésBenchmarkingSoftware deploymentComputer scienceProcess (computing)Health careCloud computingKnowledge managementData scienceBig dataProcess managementEngineering managementArtificial intelligenceBusinessSoftware engineeringEngineeringData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Medical artificial intelligence (AI) has tremendous potential to advance healthcare by supporting and contributing to the evidence-based practice of medicine, personalizing patient treatment, reducing costs, and improving both healthcare provider and patient experience. Unlocking this potential requires systematic, quantitative evaluation of the performance of medical AI models on large-scale, heterogeneous data capturing diverse patient populations. Here, to meet this need, we introduce MedPerf, an open platform for benchmarking AI models in the medical domain. MedPerf focuses on enabling federated evaluation of AI models, by securely distributing them to different facilities, such as healthcare organizations. This process of bringing the model to the data empowers each facility to assess and verify the performance of AI models in an efficient and human-supervised process, while prioritizing privacy. We describe the current challenges healthcare and AI communities face, the need for an open platform, the design philosophy of MedPerf, its current implementation status and real-world deployment, our roadmap and, importantly, the use of MedPerf with multiple international institutions within cloud-based technology and on-premises scenarios. Finally, we welcome new contributions by researchers and organizations to further strengthen MedPerf as an open benchmarking platform.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,045
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,106

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,045
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,006
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,435
Écart entre enseignants0,350 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations149
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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