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Enregistrement W4384572151 · doi:10.1139/facets-2022-0206

A combination of optimized threshold and deep learning-based approach to improve malaria detection and segmentation on PlasmoID dataset

2023· article· en· W4384572151 sur OpenAlex
Hanung Adi Nugroho, Rizki Nurfauzi

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueFACETS · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueDigital Imaging for Blood Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversitas Gadjah MadaBadan Riset dan Inovasi Nasional
Mots-clésMalariaArtificial intelligenceSegmentationComputer scienceDeep learningImage segmentationMachine learningPattern recognition (psychology)BiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malaria is a life-threatening parasitic disease transmitted to humans by infected female Anopheles mosquitoes. Early and accurate diagnosis is crucial to reduce the high mortality rate of the disease, especially in eastern Indonesia, where limited health facilities and resources contribute to the effortless spread of the disease. In rural areas, the lack of trained parasitologists presents a significant challenge. To address this issue, a computer-aided detection (CAD) system for malaria is needed to support parasitologists in evaluating hundreds of blood smear slides every month. This study proposes a hybrid automated malaria parasite detection and segmentation method using image processing and deep learning techniques. First, an optimized double-Otsu method is proposed to generate malaria parasite patch candidates. Then, deep learning approaches are applied to recognize and segment the parasites. The proposed method is evaluated on the PlasmoID dataset, which consists of 468 malaria-infected microscopic images containing 691 malaria parasites from Indonesia. The results demonstrate that our proposed approach achieved an F1-score of 0.91 in parasite detection. Additionally, it achieved better performance in terms of sensitivity, specificity, and F1-score for parasite segmentation compared to original semantic segmentation methods. These findings highlight the potential of this study to be implemented in CAD malaria detection, which could significantly improve malaria diagnosis in resource-limited areas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,477
Score d'incertitude au seuil0,372

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle