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Enregistrement W4384664492 · doi:10.1080/15412555.2023.2229906

Sex-Specific Genetic Determinants of Asthma-COPD Phenotype and COPD in Middle-Aged and Older Canadian Adults: An Analysis of CLSA Data

2023· article· en· W4384664492 sur OpenAlexafffundabout
Ugochukwu Odimba, Ambikaipakan Senthilselvan, Jamie Farrell, Zhiwei Gao

Notice bibliographique

RevueCOPD Journal of Chronic Obstructive Pulmonary Disease · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensUniversity of AlbertaHealth Sciences CentreMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of Canada
Mots-clésCOPDAsthmaMedicineSingle-nucleotide polymorphismSNPLogistic regressionPhenotypeGenome-wide association studyInternal medicineGeneticsGenotypeBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The etiology of sex differences in the risk of asthma-COPD phenotype and COPD is still not completely understood. Genetic and environmental risk factors are commonly believed to play an important role. This study aims to identify sex-specific genetic markers associated with asthma-COPD phenotype and COPD using the Canadian Longitudinal Study on Aging (CLSA) Baseline Comprehensive and Genomic data. There were a total of 1,415 COPD cases. Out of them, 504 asthma-COPD phenotype cases were identified. 20,524 participants without a diagnosis of asthma and COPD served as controls. We performed genome-wide SNP-by-sex interaction analysis. SNPs with an interaction p-value < 10−5 were included in a sex-stratified multivariable logistic regression for asthma-COPD phenotype and COPD outcomes. 18 and 28 SNPs had a significant interaction term p-value < 10−5 with sex in the regression analyses of asthma-COPD phenotype and COPD outcomes, respectively. Sex-stratified multivariable analysis of asthma-COPD phenotype showed that 7 SNPs in/near SMYD3, FHIT, ZNF608, RIMBP2, ZNF133, BPIFB1, and S100B loci were significant in males. Sex-stratified multivariable analysis of COPD showed that 8 SNPs in/near MAGI1, COX18, OSTC, ELOVL5, C7orf72 FGF14, and NKAIN4 were significant in males, and 4 SNPs in/near genes CAMTA1, SATB2, PDE10A, and LINC00908 were significant in females. An SNP in the ZPBP gene was associated with COPD in both males and females. Identification of sex-specific loci associated with asthma-COPD phenotype and COPD may offer valuable evidence toward a better understanding of the sex-specific differences in the pathophysiology of the diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,101
Score d'incertitude au seuil0,957

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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