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Enregistrement W4384692955 · doi:10.1101/2023.07.14.23292670

Immune boosting bridges leaky and polarized vaccination models

2023· preprint· en· W4384692955 sur OpenAlexaff
Sang Woo Park, Michael Li, C. Jessica E. Metcalf, Bryan T. Grenfell, Jonathan Dushoff

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensMcMaster UniversityPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVaccinationBoosting (machine learning)Epidemic modelImmune systemEconometricsMedicineImmunologyComputer scienceMathematicsEnvironmental healthArtificial intelligencePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Two different epidemiological models of vaccination are commonly used in dynamical modeling studies. The leaky vaccination model assumes that all vaccinated individuals experience a reduced force of infection by the same amount. The polarized vaccination model assumes that some fraction of vaccinated individuals are completely protected, while the remaining fraction remains completely susceptible; this seemingly extreme assumption causes the polarized model to always predict lower final epidemic size than the leaky model under the same vaccine efficacy. However, the leaky model also makes an implicit, unrealistic assumption: vaccinated individuals who are exposed to infection but not infected remain just as susceptible as they were prior to exposures (i.e., independent of previous exposures). To resolve the independence assumption, we introduce an immune boosting mechanism, through which vaccinated, yet susceptible, individuals can gain protection without developing a transmissible infection. The boosting model further predicts identical epidemic dynamics as the polarized vaccination model, thereby bridging the differences between two models. We further develop a generalized vaccination model to explore how the assumptions of immunity affect epidemic dynamics and estimates of vaccine effectiveness. Significance statement Different assumptions about the long- and medium-term effects of protective vaccination can predict sharply different epidemiological dynamics. However, there has been limited discussion about which assumptions are more realistic and therefore more appropriate for making public health decisions. Here, we show that the differences between the two most common assumptions (the “leaky” and “polarized” vaccination models) are bridged by immune boosting, a mechanism by which individuals who resist infectious challenge due to partial immunity have their immunity increased. We demonstrate that this mechanism has important implications for measuring vaccine effectiveness. Our study challenges fundamental assumptions about commonly used vaccination models and provides a novel framework for understanding the epidemiological impact of vaccination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,346
Tête enseignante GPT0,419
Écart entre enseignants0,073 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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