MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4384697724 · doi:10.1101/2023.07.17.547998

Distinct ossification trade-offs illuminate the shoulder girdle reconfiguration at the water-to-land transition

2023· preprint· en· W4384697724 sur OpenAlexaff
Janet Wei, Thomas W.P. Wood, Kathleen Flaherty, Alyssa Enny, Ali Andrescavage, Danielle Brazer, Dina Navon, Thomas A. Stewart, Hannah Cohen, Anusha Shanabag, Shunya Kuroda, Ingo Braasch, Tetsuya Nakamura

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensAbbott (Canada)University of the Fraser Valley
Organismes subventionnairesSchool of Life Sciences and Biotechnology Division of Life Sciences, Korea UniversityOffice of Advanced Research Computing, Rutgers, The State University of New JerseyNational Science Foundation
Mots-clésPectoral girdleBiologyEndochondral ossificationHedgehogVertebrateAnatomyZebrafishTetrapod (structure)OssificationPelvic girdleEvolutionary biologyCell biologyGeneticsSignal transductionGeneCartilagePaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The mechanisms of the pectoral girdle transformation at the origin of terrestrial locomotion in vertebrates remains an outstanding problem in evolutionary biology 1 . The loss of dermal bones and the enlargement of endochondral bones resulted in the disarticulation of the pectoral girdle from the skull and the formation of the neck during the fish-to-tetrapod transition 2–5 . Despite the functional implications of this skeletal shift in the emergence of terrestrial vertebrates, the underlying genetic-developmental alterations have remained enigmatic. Here, we discovered that in zebrafish pectoral girdle mesodermal cells expressing gli3 , a transcription factor in the Hedgehog signaling pathway, contribute to both dermal and endochondral bones. We show that Gli3 regulates expression of activin A receptor type 1-like , a BMP type 1 receptor lost in tetrapod lineages, and thereby determines endochondral and dermal ossification. Intriguingly, Gli and Hedgehog compound knockout fish exhibited an unexpected combination of actinopterygian fish and stem-tetrapod pectoral girdle characteristics. These ontogenetic and anatomical data suggest that a trade-off between the two distinct ossification pathways is a deeply embedded developmental program in bony fishes, with potential for tuning of this trade-off to generate novel pectoral girdle forms akin to stem-tetrapods at the dawn of vertebrate terrestrialization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,236
Score d'incertitude au seuil0,824

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetDevelopmental Biology and Gene RegulationTravaux en français237 207