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Enregistrement W4384827601 · doi:10.3389/fmicb.2023.1214915

Farm management practices and season dependent factors affect the microbial community and chemical profile of corn and grass-legume silages of farms in Ontario, Québec, and Northern New York

2023· article· en· W4384827601 sur OpenAlexafffundabout
Jesse Huffman, Pascal Drouin, Justin B. Renaud, Lysiane Dunière, Gisèle LaPointe

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaCégep Saint-Jean-sur-RichelieuUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSilageMicrobial inoculantAgronomyLegumeBiologyAnimal scienceInoculationHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The effects of farm management practices and seasonal variation on the microbial community and chemical composition of corn and grass-legume silage are largely understudied due to the advantages of controlled mini-silo experiments. This study aims to investigate the effects that some key farm factors (use of an inoculant, farm region, and bunker or tower silo) and seasonal variations have on corn and grass-legume silage from farms across Ontario, Quebec, and New York. The silage was either treated with a commercial inoculant (Lallemand Biotal Buchneri 500® or Chr Hansen SiloSolve FC®) or left untreated. The bacterial communities of silage were compared to those of raw bulk tank milk from the same farm to determine if they were similarly affected by management practices or seasonal variations. Family level analysis of the 16S rRNA V3-V4 gene amplicon bacterial community, the ITS1 amplicon fungal community, NMR water soluble metabolome, and mycotoxin LC–MS were performed on silage over a two-year period. Chemical compounds associated with the use of inoculants in corn and grass-legume silage were higher in inoculated corn (acetate, propane-1,2-diol, γ-aminobutyrate; p < 0.001) and grass-legume (propionate; p = 0.011). However, there was no significant difference in the relative abundance (RA) of Lactobacillaceae in either silage type. Leuconostocaceae was higher in non-inoculated corn (p < 0.001) and grass-legume (p < 0.001) silage than in inoculated silage. Tower silos had higher RA of Leuconostocaceae (p < 0.001) and higher pH (p < 0.001) in corn and grass-legume silage. The one farm that used liquid manure with no other fertilizer type had higher RA of Clostridiaceae (p = 0.045) and other rumen/fecal (p < 0.006) bacteria in grass-legume silage than all other farms. Seasonal variation affected most of the key silage microbial families, however the trends were rarely visible across both years. Few trends in microbial variation could be observed in both silage and bulk tank milk: two farms had higher Moraxellaceae (p < 0.001) in milk and either corn or grass-legume silage. In farms using an inoculant, lower Staphylococcaceae was observed in the raw bulk tank milk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,086
Score d'incertitude au seuil0,173

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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