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Enregistrement W4384924290 · doi:10.1007/s12265-023-10411-8

Age and Sex Differences in the Genetics of Cardiomyopathy

2023· article· en· W4384924290 sur OpenAlexafffundabout
Oyediran Akinrinade, Robert Lesurf, J. C. Ambrose, Prabhu Arumugam, Marta Bleda, F. Boardman-Pretty, C. R. Boustred, Helen Brittain, M. J. Caulfield, G. C. Chan, Tom Fowler, Adam Giess, A. Hamblin, Shirley Henderson, Tim Hubbard, R. Jackson, L. J. Jones, Dalia Kasperavičiūtė, Melis Kayikci, Athanasios Kousathanas, L. Lahnstein, S. E. A. Leigh, I. U. S. Leong, Fabrice Lopez, F. Maleady-Crowe, Loukas Moutsianas, Michael Mueller, Nirupa Murugaesu, Anna C. Need, Peter O’Donovan, Chris A. Odhams, Christine Patch, D. Perez-Gil, Mariana Buongermino Pereira, J. Pullinger, T. Rahim, A. Rendon, T. Rogers, K. Savage, K. Sawant, Richard H. Scott, Afshan Siddiq, A. Sieghart, S. C. Smith, A. Sosinsky, Alexander Stuckey, M. Tanguy, Elaine Thomas, Simon R. Thompson, Arianna Tucci, Edward E. Walsh, M. J. Welland, Eleanor Williams, Katarzyna Witkowska, S. M. Wood, Jane Lougheed, Tapas Mondal, John Smythe, Luis Altamirano‐Diaz, Erwin Oechslin, Seema Mital

Notice bibliographique

RevueJournal of Cardiovascular Translational Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensTed Rogers Centre for Heart ResearchChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity Health NetworkSickKids FoundationUniversity of TorontoKingston General HospitalLondon Health Sciences CentreMcMaster Children's HospitalHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesWellcome TrustHospital for Sick ChildrenCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UKHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésPenetranceMYH7CardiomyopathyDilated cardiomyopathyHypertrophic cardiomyopathyLMNAMedicineGeneticsGenotypeInternal medicineBiologyGeneMutationPhenotypeHeart failure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cardiomyopathy has variable penetrance. We analyzed age and sex-related genetic differences in 1,397 cardiomyopathy patients (Ontario, UK) with whole genome sequencing. Pediatric cases (n = 471) harbored more deleterious protein-coding variants in Tier 1 cardiomyopathy genes compared to adults (n = 926) (34.6% vs 25.9% respectively, p = 0.0015), with variant enrichment in constrained coding regions. Pediatric patients had a higher burden of sarcomere and lower burden of channelopathy gene variants compared to adults. Specifically, pediatric patients had more MYH7 and MYL3 variants in hypertrophic cardiomyopathy, and fewer TTN truncating variants in dilated cardiomyopathy. MYH7 variants clustered in the myosin head and neck domains in children. OBSCN was a top mutated gene in adults, enriched for protein-truncating variants. In dilated cardiomyopathy, female patients had a higher burden of z-disc gene variants compared to males. Genetic differences may explain age and sex-related variability in cardiomyopathy penetrance. Genotype-guided predictions of age of onset can inform pre-test genetic counseling. Pediatric cardiomyopathy patients were more likely to be genotype-positive than adults with a higher burden of variants in MYH7, MYL3, TNNT2, VCL. Adults had a higher burden of OBSCN and TTN variants. Females with dilated cardiomyopathy (DCM) had a higher burden of z-disc gene variants compared to males.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,066

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,135
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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