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Enregistrement W4385060961 · doi:10.4236/ajmb.2023.133012

DNA Methyltransferase Inhibitors Induce Cerebral Dopamine Neurotrophic Factor Expression in C6 Glioma Cells

2023· article· en· W4385060961 sur OpenAlexafffund
Sumeya Z. Mukhtar, Lennard P. Niles

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Molecular Biology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDNA methyltransferaseBiologyNeurotrophic factorsDNMT1MethyltransferaseBrain-derived neurotrophic factorDNA methylationMethylationGene expressionBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cerebral dopamine neurotrophic factor (CDNF) and mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor (MANF) are involved in neuroprotection and mitigating endoplasmic reticulum (ER) stress in the brain and peripheral organs. In earlier work, an increase in histone acetylation, following treatment with an epigenetic modulator, valproic acid, was associated with induction of CDNF and MANF in cultured cells and rat brain. These findings prompted an investigation of the effects of DNA methyltransferase (DNMT) inhibitors, which can alter epigenetic function, on the expression of CDNF and MANF. Rat C6 glioma cells were treated with a micromolar range of DNMT inhibitors: 5-aza-2’-deoxycytidine (DAC or decitabine), 5-azacytidine (AZA) or zebularine (ZEB) for 24 h. Subsequently, qPCR analysis was used to examine the mRNA expression of DNMT1, ten-eleven translocation methylcytosine dioxygenase 2 (TET-2), CDNF and MANF. A significant dose-dependent decrease in DNMT1 mRNA levels, together with a significant increase in TET-2 expression, was observed following treatment with AZA or DAC. Importantly, DAC, AZA and ZEB caused a significant dose-dependent increase in CDNF mRNA levels. In contrast, MANF mRNA expression decreased following treatment with AZA, with no significant effects observed with DAC or ZEB. Western analysis revealed no significant changes in CDNF protein levels following treatment with DAC for 24 h. The significant increase in CDNF expression, following treatment with DNMT1 inhibitors, suggests that DNA methylation is involved in the regulation of this neurotrophic factor. Clarification of the epigenetic or other mechanisms underlying the regulation of CDNF may provide novel therapeutic approaches in neurodegenerative and ER stress-related disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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