MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4385191661 · doi:10.1101/2023.07.20.23292771

<i>APOE</i> loss-of-function variants: Compatible with longevity and associated with resistance to Alzheimer’s Disease pathology

2023· preprint· en· W4385191661 sur OpenAlexfundno aff
Augustine Chemparathy, Yann Le Guen, Sunny Chen, Eun-Gyung Lee, Lesley Leong, John E. Gorzynski, Guangxue Xu, Michaël E. Belloy, Nandita Kasireddy, Andres Peña Tauber, Kennedy Williams, Ilaria Stewart, Thomas S. Wingo, James J. Lah, Suman Jayadev, Chad Hales, Elaine R. Peskind, Daniel D. Child, C. Dirk Keene, Le Cong, Euan A. Ashley, Chang‐En Yu, Michael D. Greicius

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilÖsterreichische ForschungsförderungsgesellschaftNational Institutes of HealthKarl-Franzens-Universität GrazErasmus Medisch CentrumNational Human Genome Research InstituteRussian Foundation for Basic ResearchAustrian Science FundZonMwEuropean CommissionCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of WashingtonEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchOffice of Research and DevelopmentU.S. Department of Veterans AffairsNancy and Buster Alvord EndowmentNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekWellcome TrustUniversity of PennsylvaniaNational Institute on AgingMedizinische Universität GrazOesterreichische NationalbankAlzheimer's Association
Mots-clésApolipoprotein EAlleleHeterozygote advantageAlzheimer's diseaseMedicineDiseaseInternal medicineOncologyGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary The ε4 allele of apolipoprotein E ( APOE ) is the strongest genetic risk factor for sporadic Alzheimer’s Disease (AD). Knockdown of this allele may provide a therapeutic strategy for AD, but the effect of APOE loss-of-function (LoF) on AD pathogenesis is unknown. We searched for APOE LoF variants in a large cohort of older controls and patients with AD and identified six heterozygote carriers of APOE LoF variants. Five carriers were controls (ages 71-90) and one was an AD case with an unremarkable age-at-onset between 75-79. Two APOE ε3/ε4 controls (Subjects 1 and 2) carried a stop-gain affecting the ε4 allele. Subject 1 was cognitively normal at 90+ and had no neuritic plaques at autopsy. Subject 2 was cognitively healthy within the age range 75-79 and underwent lumbar puncture at between ages 75-79 with normal levels of amyloid. The results provide the strongest human genetics evidence yet available suggesting that ε4 drives AD risk through a gain of abnormal function and support knockdown of APOE ε4 or its protein product as a viable therapeutic option.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemedRxiv→Même sujetAlzheimer's disease research and treatments→Travaux en français237 207→