Identification of a botulinum neurotoxin-like gene cluster in <i>Bacillus toyonensis</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Clostridial neurotoxins, which include botulinum neurotoxins (BoNTs) and tetanus neurotoxin (TeNT) are the most potent toxins known, and are the causative agents of the neuroparalytic diseases, botulism and tetanus. Until recently, the clostridial neurotoxin family was restricted to the genus Clostridium , but members of this protein family have been found in a growing number of non- Clostridium species including Weissella, Enterococcus , and Paraclostridium . Here, we report the bioinformatic identification and analysis of a novel clostridial neurotoxin homolog in a Bacillus toyonensis genome recently deposited into the NCBI Genbank database. This putative toxin shares 26-29% identity with its closest BoNT relatives, suggesting that it is likely a novel BoNT-like toxin. It possesses key functional motifs (e.g., HExxH) indicative of toxin protease activity, contains the four characteristic BoNT domains, and is located in a BoNT-like genomic neighborhood containing the upstream non-toxic non-hemagglutinin (NTNH) gene as well as several P47-related genes. Phylogenetically, the toxin clusters as a divergent member of the recently discovered lineage of BoNT-like toxins that includes BoNT/X, BoNT/En, and the insecticidal PMP1. Genomic analysis of the B. toyonensis isolate CH177 revealed additional virulence factors and toxin genes indicative of potential pathogenicity targeting an unknown host species. The Bacillus toyonensis BoNT-like protein (BTNT) adds to a growing number of non-clostridial BoNT-like toxins, adding further information on the intriguing phylogenetic distribution and evolutionary history of the most potent toxins known.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».