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Enregistrement W4385263679 · doi:10.1042/bcj20230254

RyR2 C-terminal truncating variants identified in patients with arrhythmic phenotypes exert a dominant negative effect through formation of wildtype-truncation heteromers

2023· article· en· W4385263679 sur OpenAlexafffund
Shanshan Tian, Xiaowei Zhong, Hui Wang, Jinhong Wei, Wenting Guo, Ruiwu Wang, John Paul Estillore, Carlo Napolitano, Henry H. Duff, Erkan İlhan, Linda M. Knight, Michael S. Lloyd, Jason D. Roberts, Silvia G. Priori, S.R. Wayne Chen

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensMcMaster UniversityPopulation Health Research InstituteHamilton Health SciencesLibin Cardiovascular Institute of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta InnovatesAlberta Innovates - Health SolutionsGovernment of CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésRyanodine receptor 2Catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardiaMissense mutationHEK 293 cellsRyanodine receptorBiologyGeneticsPhenotypeReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gain-of-function missense variants in the cardiac ryanodine receptor (RyR2) are linked to catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia (CPVT), whereas RyR2 loss-of-function missense variants cause Ca2+ release deficiency syndrome (CRDS). Recently, truncating variants in RyR2 have also been associated with ventricular arrhythmias (VAs) and sudden cardiac death. However, there are limited insights into the potential clinical relevance and in vitro functional impact of RyR2 truncating variants. We performed genetic screening of patients presenting with syncope, VAs, or unexplained sudden death and in vitro characterization of the expression and function of RyR2 truncating variants in HEK293 cells. We identified two previously unknown RyR2 truncating variants (Y4591Ter and R4663Ter) and one splice site variant predicted to result in a frameshift and premature termination (N4717 + 15Ter). These 3 new RyR2 truncating variants and a recently reported RyR2 truncating variant, R4790Ter, were generated and functionally characterized in vitro. Immunoprecipitation and immunoblotting analyses showed that all 4 RyR2 truncating variants formed heteromers with the RyR2-wildtype (WT) protein. Each of these C-terminal RyR2 truncations was non-functional and suppressed [3H]ryanodine binding to RyR2-WT and RyR2-WT mediated store overload induced spontaneous Ca2+ release activity in HEK293 cells. The expression of these RyR2 truncating variants in HEK293 cells was markedly reduced compared with that of the full-length RyR2 WT protein. Our data indicate that C-terminal RyR2 truncating variants are non-functional and can exert a dominant negative impact on the function of the RyR2 WT protein through formation of heteromeric WT/truncation complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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