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Enregistrement W4385287091 · doi:10.1098/rsos.221656

COVID-19 transmission dynamics and the impact of vaccination: modelling, analysis and simulations

2023· article· en· W4385287091 sur OpenAlexafffund
Joseph Malinzi, Victor Ogesa Juma, Chinwendu E. Madubueze, John Mwaonanji, Godwin Nwachukwu Nkem, Elias Mwakilama, Tinashe Victor Mupedza, Vincent Nandwa Chiteri, Emmanuel A. Bakare, Isabel Linda-Zulu Moyo, Eduard Campillo-Funollet, Farai Nyabadza, Anotida Madzvamuse

Notice bibliographique

RevueRoyal Society Open Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaYork University
Organismes subventionnairesDivision of Mathematical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGlobal Challenges Research FundUniversity of JohannesburgRoyal SocietyUniversity of PretoriaNational Research FoundationWolfson FoundationEngineering and Physical Sciences Research CouncilNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)AlgorithmVaccinationStability (learning theory)Computer scienceStatisticsMachine learningMathematicsMedicineVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the lifting of COVID-19 restrictions, the COVID-19 pandemic and its effects remain a global challenge including the sub-Saharan Africa (SSA) region. Knowledge of the COVID-19 dynamics and its potential trends amidst variations in COVID-19 vaccine coverage is therefore crucial for policy makers in the SSA region where vaccine uptake is generally lower than in high-income countries. Using a compartmental epidemiological model, this study aims to forecast the potential COVID-19 trends and determine how long a wave could be, taking into consideration the current vaccination rates. The model is calibrated using South African reported data for the first four waves of COVID-19, and the data for the fifth wave are used to test the validity of the model forecast. The model is qualitatively analysed by determining equilibria and their stability, calculating the basic reproduction number <mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"> <mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi mathvariant="script">R</mml:mi> </mml:mrow> <mml:mn>0</mml:mn> </mml:msub> </mml:math> and investigating the local and global sensitivity analysis with respect to <mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"> <mml:msub> <mml:mrow> <mml:mi mathvariant="script">R</mml:mi> </mml:mrow> <mml:mn>0</mml:mn> </mml:msub> </mml:math> . The impact of vaccination and control interventions are investigated via a series of numerical simulations. Based on the fitted data and simulations, we observed that massive vaccination would only be beneficial (deaths averting) if a highly effective vaccine is used, particularly in combination with non-pharmaceutical interventions. Furthermore, our forecasts demonstrate that increased vaccination coverage in SSA increases population immunity leading to low daily infection numbers in potential future waves. Our findings could be helpful in guiding policy makers and governments in designing vaccination strategies and the implementation of other COVID-19 mitigation strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,688
Score d'incertitude au seuil0,702

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,175
Tête enseignante GPT0,473
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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