Does soil history decline in influencing the structure of bacterial communities of <i>Brassica napus</i> host plants across different growth stages?
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Soil history has been shown to condition future plant-soil microbial communities up to a year after being established. However, previous experiments have also illustrated that mature, adult plants can “re-write”, or mask, different soil histories through host plant-soil microbial community feedbacks. This leaves a knowledge gap concerning how soil history influences bacterial community structure across different growth stages. Therefore, in this experiment we tested the hypothesis that previously established soil histories will decrease in influencing the structure of Brassica napus bacterial communities over the growing season. We used an on-going agricultural field experiment to establish three different soil histories, plots of monocrop canola ( B . napus ), or rotations of wheat-canola, or pea-barley-canola. During the following season, we repeatedly sampled the surrounding bulk soil, rhizosphere and roots of B . napus at different growth stages— the initial seeding conditions, seedling, rosette, bolting, and flower— from all three soil history plots. We compared the taxonomic composition and diversity of bacterial communities, as estimated using 16S rRNA metabarcoding, to identify any changes associated with soil history and growth stages on the different B. napus soil bacterial communities. We found that soil history remained significant across each growth stage in structuring the bulk soil and rhizosphere communities, but not the roots. This suggests that the host plant’s capacity to “re-write” different soil histories may be quite limited as key components that constitute the soil history’s identity remain present and continue to impact bacterial communities. For agriculture, this highlights how previously established soil histories persist and may have important long-term consequences on future plant-microbe communities, including bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».