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Enregistrement W4385330871 · doi:10.1111/mmi.15131

The <i>fadXDEBA</i> locus of <i>Staphylococcus aureus</i> is required for metabolism of exogenous palmitic acid and in vivo growth

2023· article· en· W4385330871 sur OpenAlexafffund
Robert C. Kuiack, Stephen W. Tuffs, Karine Dufresne, Robert Flick, John K. McCormick, Martin J. McGavin

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteUniversity of TorontoWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyPalmitic acidMetabolismBiochemistryPhospholipidFatty acidStaphylococcus aureusMetaboliteLipid metabolismFatty acid metabolismMetabolic pathwayStearic acidBacteriaChemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Staphylococcus aureus, genes that should confer the capacity to metabolize fatty acids by β-oxidation occur in the fadXDEBA locus, but their function has not been elucidated. Previously, incorporation into phospholipid through the fatty acid kinase FakA pathway was thought to be the only option available for S. aureus to metabolize exogenous saturated fatty acids. We now find that in S. aureus USA300, a fadX::lux reporter was repressed by glucose and induced by palmitic acid but not stearic acid, while in USA300ΔfakA basal expression was significantly elevated, and enhanced in response to both fatty acids. When cultures were supplemented with palmitic acid, palmitoyl-CoA representing the first metabolite in the β-oxidation pathway was detected in USA300, but not in a fadXDEBA deletion mutant USA300Δfad, which relative to USA300 exhibited increased incorporation of palmitic acid into phospholipid accompanied by a rapid loss of viability. USA300Δfad also exhibited significantly reduced viability in a murine tissue abscess infection model. Our data are consistent with FakA-mediated incorporation of fatty acids into phospholipid as a preferred pathway for metabolism of exogenous fatty acids, while the fad locus is critical for metabolism of palmitic acid, which is the most abundant free fatty acid in human plasma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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