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Enregistrement W4385357432 · doi:10.1016/j.cmi.2023.07.011

A contemporary review of clade-specific virological differences in monkeypox viruses

2023· review· en· W4385357432 sur OpenAlexaff
Tochi Okwor, Placide Mbala, David H. Evans, Jason Kindrachuk

Notice bibliographique

RevueClinical Microbiology and Infection · 2023
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMonkeypoxZoonosisCladeSubcladeOrthopoxvirusOutbreakVirologyTransmission (telecommunications)BiologyInfluenza A virus subtype H5N1BetacoronavirusNatural reservoirVirusPhylogenetic treeDiseaseMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Infectious disease (medical specialty)Vaccinia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Monkeypox virus (MPXV) is an emerging zoonotic virus that has had on-going public health impacts in endemic regions of Central and West Africa for over a half-century. Historically, the MPXV clade endemic in regions of Central Africa is associated with higher morbidity and mortality as compared with the clade endemic in West Africa. OBJECTIVES: Here, we review the virological characteristics of MPXV and discuss potential relationships between virulence factors and clade- (and subclade-) specific differences in virulence and transmission patterns. SOURCES: Targeted search was conducted in PubMed using ((monkeypox virus) OR (Orthopoxvirus)) AND (zoonosis)) OR ((monkeypox) OR (human mpox). CONTENT: Forty-seven references were considered that included three publicly available data reports and/or press releases, one book chapter, and 44 published manuscripts. IMPLICATIONS: Although zoonosis has been historically linked to emergence events in humans, epidemiological analyses of more recent outbreaks have identified increasing frequencies of human-to-human transmission. Furthermore, viral transmission during the 2022 global human mpox outbreak, caused by a recently identified MPXV subclade, has relied exclusively on human-to-human contact with no known zoonotic link.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0060,007
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,291
Tête enseignante GPT0,432
Écart entre enseignants0,141 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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