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Enregistrement W4385374278 · doi:10.1038/s41598-023-37458-6

Leishmania donovani persistence and circulation causing cutaneous leishmaniasis in unusual-foci of Nepal

2023· article· en· W4385374278 sur OpenAlexaff
Tinmaya Rai, Srijan Lal Shrestha, Sabita Prajapati, Anup Bastola, Niraj Parajuli, Pragya Gautam Ghimire, Parmananda Bhandari, Kishor Pandey, Manju Jain, Greg Matlashewski, Rachel Bras‐Gonçalves, Krishna Das Manandhar

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCentre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le DéveloppementUniversity Grants Commission- NepalMinistry of Education, Science and TechnologyBanaras Hindu UniversityTribhuvan University
Mots-clésLeishmania donovaniKinetoplastCutaneous leishmaniasisInternal transcribed spacerBiologyVisceral leishmaniasisParasite hostingLeishmaniasisPolymerase chain reactionLeishmaniaVirologyImmunologyDNAGeneticsGeneRibosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cutaneous leishmaniasis cases have increased dramatically in recent years in Nepal. The study offers molecular identification of the Leishmania species using 40 patient's aspiration biopsy samples, targeting markers kinetoplast minicircle DNA (kDNA) and internal transcribed spacer-1 (ITS1). Among molecularly diagnosed 22 cutaneous leishmaniasis cases, L. donovani complex was identified in 13 instances and L. major in 9 cases. The ITS1 PCR was positive in 12 of the positive nested- kDNA PCR cases (12/22), confirming L. donovani complex in seven of the cases and L. major in five of the cases. In addition, the study conclude that concurrent occurrence of atypical cutaneous infections caused by L. donovani parasite in 59.1% of cases and typical cutaneous infections caused by L. major parasite in 40.9% of cases. A Phylogentic analaysis showed that the detected L. donovani species present null genetic distances from seven references of L. donovani, but slight differences between ITS1 sequences and not grouped into a significant monophyletic cluster.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,145
Score d'incertitude au seuil0,709

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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