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Enregistrement W4385407642 · doi:10.1002/ange.202308692

Fragment‐Screening und schnelle mikromolare Detektion mit einem Benchtop‐NMR‐Spektrometer ermöglicht durch photoinduzierte Hyperpolarisation

2023· article· de· W4385407642 sur OpenAlexaff
Gabriela R. Stadler, Takuya F. Segawa, Matthias Bütikofer, Venita Decker, Sandra Loss, Barbara Czarniecki, Felix Torres, Roland Riek

Notice bibliographique

RevueAngewandte Chemie · 2023
Typearticle
Languede
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced NMR Techniques and Applications
Établissements canadiensNexen (Canada)
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungEidgenössische Technische Hochschule ZürichVerein fur Krebsforschung
Mots-clésChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Fragmentbasiertes Wirkstoffdesign ist eine gut etablierte Strategie für rationales Arzneimitteldesign, wobei die Kernspinresonanzspektroskopie (NMR) auf Hochfeldspektrometern als Referenzmethode für das Screening und die Hit‐Validierung dient. Hochfeld‐NMR‐Spektrometer sind jedoch nicht nur teuer, sondern erfordern auch eine spezielle Wartung, einen speziellen Raum und sind auf die Kühlung mit flüssigem Helium angewiesen, was angesichts der wiederkehrenden weltweiten Heliumknappheit kritisch geworden ist. Wir schlagen eine Alternative zum Hochfeld‐NMR‐Screening vor, indem wir den kürzlich entwickelten Ansatz des Fragment‐Screenings durch photoinduzierte hyperpolarisierte NMR auf einem kryogenfreien 80‐MHz‐Benchtop‐NMR‐Spektrometer anwenden, der Signalverstärkungen von bis zu drei Größenordnungen ermöglicht. Es wird gezeigt, dass es möglich ist, mit einem Benchtop‐NMR‐Spektrometer bei niedrigen mikromolaren Konzentrationen sowohl von Proteinen als auch von Liganden neue Hits zu entdecken und die Entwicklung von Medikamenten einzuleiten. Der vorgestellte Ansatz arbeitet mit höherer Geschwindigkeit als moderne Hochfeld‐NMR‐Ansätze und weist eine Nachweisgrenze im nanomolaren Bereich auf. Die photoinduzierte Hyperpolarisation ist bekanntlich kostengünstig und einfach zu implementieren, was der Philosophie von Benchtop‐NMR‐Spektrometern sehr entgegenkommt. Diese Ergebnisse ebnen den Weg für den Einsatz von Benchtop‐NMRunter nahezu physiologischen Bedingungen für die Entwicklung von Arzneimitteln und weitere Life‐Science‐Anwendungen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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