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Enregistrement W4385460202 · doi:10.3389/fnmol.2023.1176823

A new Hoxb8FlpO mouse line for intersectional approaches to dissect developmentally defined adult sensorimotor circuits

2023· article· en· W4385460202 sur OpenAlexaff
Manon Bohic, Aman Upadhyay, Jaclyn T. Eisdorfer, Jessica Keating, Rhiana C. Simon, Brandy A. Briones, Chloe Azadegan, Hannah D. Nacht, Olisemeka Oputa, A Martínez, Bridget N. Bethell, Mark A. Gradwell, Peter Romanienko, Matt S. Ramer, Garret D. Stuber, Victoria E. Abraira

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Neuroscience · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neural Engineering
Établissements canadiensInternational Collaboration On Repair DiscoveriesUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNew Jersey Commission on Spinal Cord ResearchNational Center for Research ResourcesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Institute on Drug AbuseCraig H. Neilsen Foundation
Mots-clésNeuroscienceLine (geometry)BiologyPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Improvements in the speed and cost of expression profiling of neuronal tissues offer an unprecedented opportunity to define ever finer subgroups of neurons for functional studies. In the spinal cord, single cell RNA sequencing studies support decades of work on spinal cord lineage studies, offering a unique opportunity to probe adult function based on developmental lineage. While Cre/Flp recombinase intersectional strategies remain a powerful tool to manipulate spinal neurons, the field lacks genetic tools and strategies to restrict manipulations to the adult mouse spinal cord at the speed at which new tools develop. This study establishes a new workflow for intersectional mouse-viral strategies to dissect adult spinal function based on developmental lineages in a modular fashion. To restrict manipulations to the spinal cord, we generate a brain-sparing Hoxb8 FlpO mouse line restricting Flp recombinase expression to caudal tissue. Recapitulating endogenous Hoxb8 gene expression, Flp-dependent reporter expression is present in the caudal embryo starting day 9.5. This expression restricts Flp activity in the adult to the caudal brainstem and below. Hoxb8 FlpO heterozygous and homozygous mice do not develop any of the sensory or locomotor phenotypes evident in Hoxb8 heterozygous or mutant animals, suggesting normal developmental function of the Hoxb8 gene and protein in Hoxb8 FlpO mice. Compared to the variability of brain recombination in available caudal Cre and Flp lines, Hoxb8 FlpO activity is not present in the brain above the caudal brainstem, independent of mouse genetic background. Lastly, we combine the Hoxb8 FlpO mouse line with dorsal horn developmental lineage Cre mouse lines to express GFP in developmentally determined dorsal horn populations. Using GFP-dependent Cre recombinase viruses and Cre recombinase-dependent inhibitory chemogenetics, we target developmentally defined lineages in the adult. We show how developmental knock-out versus transient adult silencing of the same ROR𝛃 lineage neurons affects adult sensorimotor behavior. In summary, this new mouse line and viral approach provides a blueprint to dissect adult somatosensory circuit function using Cre/Flp genetic tools to target spinal cord interneurons based on genetic lineage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,313
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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