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Enregistrement W4385462634 · doi:10.3389/fonc.2023.1256461

Editorial: New emerging functions of transcription factors and RNA-binding proteins in the development of hematological malignancies

2023· editorial· en· W4385462634 sur OpenAlexafffund
Tarik Möröy, Cyrus Khandanpour

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Oncology · 2023
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchDeutsche KrebshilfeDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésTranscription factorCancer researchRNA-binding proteinMedicineInternal medicineRNAOncologyBioinformaticsBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Editorial on the Research Topic New emerging functions of transcription factors and RNA-binding proteins in the development of hematological malignancies Hematological malignancies such as acute or chronic leukemias and lymphomas belong to a group of cancers that affect the blood, bone marrow and peripheral lymphoid organs and continue to present significant challenges for diagnosis and treatment primarily because of their diversity and heterogeneity.Recent research has shed light on the roles of transcription factors (TFs) and RNA-binding proteins (RBPs), that both are intimately linked to the development and progression of hematological malignancies because they control the generation, stability and translation of mRNA.This editorial aims to summarize the findings and conclusions from a set of six articles available in the Frontiers Research Topic "New Emerging Functions of Transcription Factors and RNA-Binding Proteins in the Development of Hematological Malignancies" on Frontiers in Oncology.The functionality and longevity of hematopoietic tissue from which leukemia and lymphoma can emerge is ensured by a tightly controlled balance between self-renewal, quiescence, and differentiation of hematopoietic stem cells (HSCs) into the many different blood lineages.Benyoucef et al. describe how Transcription Factors (TFs) regulate this by translating signals from extrinsic factors into specific gene expression programs.Any aberration or mutation that alters the function of TFs will affect HSCs and their ability to self-renew or differentiate and thus bear the risks to trigger transformation processes that lead to a malignancy.When TFs are mutated or activated in hematological malignancies, they are responsible for specific gene expression patterns that are different from those found in normal cells.These aberrations can be measured and, in many cases, initiate a leukemia or lymphoma or drive their progression.However, they are not only characteristic for certain types of leukemia, but they provide a typical, recurring signature, that can be used for diagnosis or to make a prognostic estimate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,092

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0070,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0270,016

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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