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Enregistrement W4385477459 · doi:10.1002/mds.29559

As Frequent as Polyglutamine Spinocerebellar Ataxias: <scp>SCA27B</scp> in a Large German Autosomal Dominant Ataxia Cohort

2023· letter· en· W4385477459 sur OpenAlexafffundabout
Holger Hengel, David Pellerin, Carlo Wilke, Zofia Fleszar, Bernard Brais, Tobias B. Haack, Andreas Traschütz, Lüdger Schöls, Matthis Synofzik

Notice bibliographique

RevueMovement Disorders · 2023
Typeletter
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesElse Kröner-Fresenius-StiftungDeutsche ForschungsgemeinschaftGénome Québec
Mots-clésSpinocerebellar ataxiaTrinucleotide repeat expansionAtaxiaCohortPopulationGeneticsBiologyMedicineInternal medicineNeuroscienceGeneAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

German Autosomal Dominant Ataxia CohortIntronic GAA repeat expansions in the fibroblast growth factor 14 gene (FGF14) have recently been shown to be a common cause of adult-onset degenerative ataxia (spinocerebellar ataxia 27B [SCA27B], MIM: 620174), 1,2 but frequencies in strictly consecutive SCA cohorts are unknown.Here we studied the relative frequencies of SCA27B in a cohort of genetically undetermined autosomal dominant cerebellar ataxia (ADCAs) and relative to other forms of genetically confirmed SCAs. ADCA ScreeningWe screened a consecutive cohort of 79 German patients from 51 families with genetically undetermined ADCA for the intronic FGF14 GAA repeat expansion.All index patients were negative for SCA types 1, 2, 3, 6, 7, and 17 and negative on either exome or short-read genome sequencing.Detailed inclusion criteria and methods are outlined in the Supporting Information.Twenty-Six of 51 families (26/79 patients) were found to carry a FGF14 (GAA) ≥250 expansion, thus accounting for 31% of patients with ADCA (Fig. 1A).Although only expansions of at least 250 GAA repeat units were considered pathogenic 1,2 and used for the current frequency analysis, we identified one family with late-onset largely pure cerebellar ataxia, and thus compatible with SCA27B, 3 in which the index patient had a repeat count of 256 GAA units, whereas her affected mother had a repeat count of 234 repeat units (Supporting Information Fig. S2).This indicates that the pathogenic threshold might be even be lower than the previously established cutoff of 250 repeat units.This hypothesis warrants further confirmation in future larger segregation and population studies.Moreover, a (GAAGGA) n repeat expansion was found in three index patients.This hexanucleotide expansion did not segregate with disease in all three families (Supporting Information Fig. S1).This provides further evidence for previous observations suggesting that non-GAA repeat expansions are unlikely pathogenic 1 and warrants caution on recent discussions of its pathogenicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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