As Frequent as Polyglutamine Spinocerebellar Ataxias: <scp>SCA27B</scp> in a Large German Autosomal Dominant Ataxia Cohort
Notice bibliographique
Résumé
German Autosomal Dominant Ataxia CohortIntronic GAA repeat expansions in the fibroblast growth factor 14 gene (FGF14) have recently been shown to be a common cause of adult-onset degenerative ataxia (spinocerebellar ataxia 27B [SCA27B], MIM: 620174), 1,2 but frequencies in strictly consecutive SCA cohorts are unknown.Here we studied the relative frequencies of SCA27B in a cohort of genetically undetermined autosomal dominant cerebellar ataxia (ADCAs) and relative to other forms of genetically confirmed SCAs. ADCA ScreeningWe screened a consecutive cohort of 79 German patients from 51 families with genetically undetermined ADCA for the intronic FGF14 GAA repeat expansion.All index patients were negative for SCA types 1, 2, 3, 6, 7, and 17 and negative on either exome or short-read genome sequencing.Detailed inclusion criteria and methods are outlined in the Supporting Information.Twenty-Six of 51 families (26/79 patients) were found to carry a FGF14 (GAA) ≥250 expansion, thus accounting for 31% of patients with ADCA (Fig. 1A).Although only expansions of at least 250 GAA repeat units were considered pathogenic 1,2 and used for the current frequency analysis, we identified one family with late-onset largely pure cerebellar ataxia, and thus compatible with SCA27B, 3 in which the index patient had a repeat count of 256 GAA units, whereas her affected mother had a repeat count of 234 repeat units (Supporting Information Fig. S2).This indicates that the pathogenic threshold might be even be lower than the previously established cutoff of 250 repeat units.This hypothesis warrants further confirmation in future larger segregation and population studies.Moreover, a (GAAGGA) n repeat expansion was found in three index patients.This hexanucleotide expansion did not segregate with disease in all three families (Supporting Information Fig. S1).This provides further evidence for previous observations suggesting that non-GAA repeat expansions are unlikely pathogenic 1 and warrants caution on recent discussions of its pathogenicity.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».