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Enregistrement W4385495098 · doi:10.1038/s44276-023-00007-9

Circulating extracellular vesicles containing S100A9 reflect histopathology, immunophenotype and therapeutic responses of liver metastasis in colorectal cancer patients

2023· article· en· W4385495098 sur OpenAlexafffund
Migmar Tsamchoe, Anthoula Lazaris, Diane Kim, Lucyna Krzywoń, Jessica Bloom, Thomas U. Mayer, Stephanie Petrillo, Kurt Dejgaard, Zu‐Hua Gao, Janusz Rak, Peter Metrakos

Notice bibliographique

RevueBJC Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensMontreal Children's HospitalUniversity of British ColumbiaMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéMcGill University Health CentreMcGill University
Mots-clésColorectal cancerHistopathologyMetastasisImmunophenotypingExtracellular vesiclesMedicinePathologyExtracellularCancerOncologyInternal medicineCancer researchBiologyImmunologyFlow cytometryCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Metastasis is the principal cause of cancer treatment failure and an area of dire diagnostic needs. Colorectal cancer metastases to the liver (CRCLMs) are predominantly classified into desmoplastic and replacement based on their histological growth patterns (HGPs). Desmoplastic responds well to current treatments, while replacement HGP has a poor prognosis with low overall survival rates. METHODS: We hypothesised that complex cellular response underlying HGPs may be reflected in the proteome of circulating extracellular vesicles (EVs). EV proteomics data was generated through LC-MS/MS and analysed with Maxquant and Perseus. To validate the S100A9 signature, ELISA was performed, and IHC and IF were conducted on tissue for marker detection and colocalization study. RESULTS: Plasma EV proteome signature distinguished desmoplastic from the replacement in patients with 22 differentially expressed proteins, including immune related markers. Unsupervised PCA analysis revealed clear separation of the two lesions. The marker with the highest confidence level to stratify the two HGPs was S100A9, which was traced in CRCLM lesions and found to colocalize with macrophages and neutrophils. EV-associated S100A9 in plasma may reflect the innate immunity status of metastatic lesions and their differential therapeutic responses. CONCLUSION: Plasma EV-derived S100A9 could be useful in personalising therapy in patients with CRCLM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,458
Score d'incertitude au seuil0,723

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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