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Enregistrement W4385495211 · doi:10.1186/s12884-023-05679-2

Predicting adverse outcomes in pregnant patients positive for SARS-CoV-2: a machine learning approach- a retrospective cohort study

2023· article· en· W4385495211 sur OpenAlexafffund
Dylan Young, Bita Houshmand, Chunyi Tan, Abirami Kirubarajan, Ashna Parbhakar, Wendy Whittle, Mara Sobel, Luis M. Gómez, Mario Rüdiger, Ulrich Pecks, Peter Oppelt, Joel G. Ray, Sebastian R. Hobson, John W. Snelgrove, Rohan D’Souza, Rasha Kashef, Dafna Sussman

Notice bibliographique

RevueBMC Pregnancy and Childbirth · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Impact on Reproduction
Établissements canadiensMount Sinai HospitalMcMaster UniversityUniversity of TorontoToronto Metropolitan UniversitySt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFedDev Ontario
Mots-clésMedicineReproductive medicineRetrospective cohort studySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Cohort studyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)CohortAdverse effectPregnancy2019-20 coronavirus outbreakObstetricsInternal medicineVirologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Pregnant people are particularly vulnerable to SARS-CoV-2 infection and to ensuing severe illness. Predicting adverse maternal and perinatal outcomes could aid clinicians in deciding on hospital admission and early initiation of treatment in affected individuals, streamlining the triaging processes. METHODS: An international repository of 1501 SARS-CoV-2-positive cases in pregnancy was created, consisting of demographic variables, patient comorbidities, laboratory markers, respiratory parameters, and COVID-19-related symptoms. Data were filtered, preprocessed, and feature selection methods were used to obtain the optimal feature subset for training a variety of machine learning models to predict maternal or fetal/neonatal death or critical illness. RESULTS: The Random Forest model demonstrated the best performance among the trained models, correctly identifying 83.3% of the high-risk patients and 92.5% of the low-risk patients, with an overall accuracy of 89.0%, an AUC of 0.90 (95% Confidence Interval 0.83 to 0.95), and a recall, precision, and F1 score of 0.85, 0.94, and 0.89, respectively. This was achieved using a feature subset of 25 features containing patient characteristics, symptoms, clinical signs, and laboratory markers. These included maternal BMI, gravidity, parity, existence of pre-existing conditions, nicotine exposure, anti-hypertensive medication administration, fetal malformations, antenatal corticosteroid administration, presence of dyspnea, sore throat, fever, fatigue, duration of symptom phase, existence of COVID-19-related pneumonia, need for maternal oxygen administration, disease-related inpatient treatment, and lab markers including sFLT-1/PlGF ratio, platelet count, and LDH. CONCLUSIONS: We present the first COVID-19 prognostication pipeline specifically for pregnant patients while utilizing a large SARS-CoV-2 in pregnancy data repository. Our model accurately identifies those at risk of severe illness or clinical deterioration, presenting a promising tool for advancing personalized medicine in pregnant patients with COVID-19.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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