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Enregistrement W4385515498 · doi:10.1101/2023.08.03.550084

Heterologous expression of influenza hemagglutinin leads to early and transient activation of the unfolded protein response in <i>Nicotiana benthamiana</i>

2023· preprint· en· W4385515498 sur OpenAlexafffund
Louis‐Philippe Hamel, Marc‐André Comeau, Rachel Tardif, Francis Poirier- Gravel, Marie‐Ève Paré, Pierre‐Olivier Lavoie, Marie‐Claire Goulet, Dominique Michaud, Marc‐André D’Aoust

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTransgenic Plants and Applications
Établissements canadiensUniversité LavalMedicago (Canada)
Organismes subventionnairesNatural Resources CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité Laval
Mots-clésUnfolded protein responseNicotiana benthamianaHemagglutinin (influenza)BiologyEndoplasmic reticulumCell biologyDownregulation and upregulationTransgeneGene expressionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary The unfolded protein response (UPR) allows cells to cope with endoplasmic reticulum (ER) stress induced by the accumulation of misfolded proteins in the ER. Due to its sensitivity to Agrobacterium tumefaciens , model plant Nicotiana benthamiana is widely employed for the transient expression of recombinant proteins of biopharmaceutical interest, including therapeutic antibodies and virus surface proteins used for vaccine production. As such, study of the plant UPR is of practical significance, since enforced expression of complex secreted proteins often results in ER stress. After 6 days of expression, we recently reported that influenza hemagglutinin (HA) induces accumulation of UPR proteins. Since the upregulation of corresponding UPR genes was not detected at this time point, accumulation of UPR proteins was hypothesized to either be independent of transcriptional regulation, or associated with early but transient UPR gene upregulation. Using time course sampling, we here show that HA expression does result in early and transient activation of the UPR, as inferred from unconventional splicing of NbbZIP60 transcripts and induction of UPR genes with varied functions. The transient nature of HA-induced UPR suggests that this response was sufficient to cope with ER stress provoked by expression of the secreted protein, as opposed to an antibody that triggered a stronger and more sustained UPR. As defense-related genes were induced after the peak of UPR activation and correlated with high increase in HA protein accumulation, we hypothesize that these immune responses, rather than the UPR, were responsible for the onset of necrotic symptoms on HA-expressing leaves. One-sentence summary Agrobacterium -mediated expression of influenza hemagglutinin results in early and transient activation of the unfolded protein response, preventing deleterious effects caused by unresolved endoplasmic reticulum stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,366
Score d'incertitude au seuil0,830

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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