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Enregistrement W4385519644 · doi:10.1101/2023.08.01.551551

Phenological mismatch between trees and wildflowers: Reconciling divergent findings in two recent analyses

2023· preprint· en· W4385519644 sur OpenAlexafffund
Benjamin R. Lee, Evelyn F. Alecrim, Jessica R. K. Forrest, J. Mason Heberling, Richard B. Primack, Risa D. Sargent

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Research, Innovation and ScienceNational Science Foundation
Mots-clésHerbariumPhenologySelection (genetic algorithm)InferenceRange (aeronautics)EcologyClimate changeGeographyBiologyComputer scienceMachine learningArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Recent evidence suggests that community science and herbarium datasets yield similar estimates of species’ phenological sensitivities to temperature. Despite this, two recent studies by Alecrim et al. (2023) and Miller et al. (2022) found contradictory results when investigating an identical ecological mechanism (phenological mismatch of wildflower flowering and of shading by deciduous trees; “phenological escape”) with separate datasets. Here, we investigated whether differences between the two studies’ results could be reconciled by testing four hypotheses related to model design, species selection, spatiotemporal data extent, and phenophase selection. Hybrid model structures brought results from the two datasets closer together but did not fully reconcile the differences between the studies. Cropping the datasets to match spatial and temporal extents appeared to reconcile most differences but only at the cost of much higher uncertainty associated with reduced sample size. Neither species selection nor phenophase selection seemed to be responsible for differences in results. Synthesis: Our analysis suggests that although species-level estimates of phenological sensitivity may be similar between crowd-sourced and herbarium datasets, inherent differences in the types and extent of data may lead to contradictory inference about complex biotic interactions. We conclude that, until community science data repositories grow to match the range of climate conditions present in herbarium collections or until herbarium collections grow to match the spatial extent and temporal frequency of community science repositories, ecological studies should ideally be evaluated using both datasets to test the possibility of biased results from either.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,095
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,278
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil0,504

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0950,278
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0060,005
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0040,005
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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