A Hydroponic-Based Bioassay to Facilitate <i>Plasmodiophora brassicae</i> Phenotyping
Notice bibliographique
Résumé
Clubroot, caused by the obligate parasite Plasmodiophora brassicae, is one of the most devastating diseases affecting the canola/oilseed rape (Brassica napus) industry worldwide. Currently, the planting of clubroot-resistant (CR) cultivars is the most effective strategy used to restrict the spread and the economic losses linked to the disease. However, virulent P. brassicae isolates have been able to infect many of the currently available CR cultivars, and the options to manage the disease are becoming limited. Another challenge has been achieving consistency in evaluating host reactions to P. brassicae infection, with most bioassays conducted in soil and/or potting medium, which requires significant space and can be labor intensive. Visual scoring of clubroot symptom development can also be influenced by user bias. Here, we have developed a hydroponic bioassay using well-characterized P. brassicae single-spore isolates representative of clubroot virulence in Canada, as well as field isolates from three Canadian provinces in combination with canola inbred homozygous lines carrying resistance genetics representative of CR cultivars available to growers in Canada. To improve the efficiency and consistency of disease assessment, symptom severity scores were compared with clubroot evaluations based on the scanned root area. According to the results, this bioassay offers a reliable, less expensive, and reproducible option to evaluate P. brassicae virulence, as well as to identify which canola resistance profile(s) may be effective against particular isolates. This bioassay will contribute to the breeding of new CR canola cultivars and the identification of virulence genes in P. brassicae that could trigger resistance and that have been very elusive to this day. [Formula: see text] Copyright © 2024 The Author(s). This is an open access article distributed under the CC BY-NC-ND 4.0 International license .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».