MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4385564203 · doi:10.1002/ijc.34667

Three‐dimensional nuclear architecture distinguishes thyroid cancer histotypes

2023· article· en· W4385564203 sur OpenAlexaff
Aline Rangel‐Pozzo, Filipe F. dos Santos, Tinuccia Dettori, Matteo Giulietti, Daniela Virginia Frau, Pedro A. F. Galante, Roberta Vanni, Alok Pathak, Gábor Fischer, John G. Gartner, Paola Caria, Sabine Mai

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThyroid Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of WinnipegUniversity of ManitobaCancerCare Manitoba
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloUniversità degli Studi di Cagliari
Mots-clésThyroid carcinomaThyroid cancerThyroidThyroid neoplasmMedicinePathologyPapillary thyroid cancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Molecular markers can serve as diagnostic tools to support pathological analysis in thyroid neoplasms. However, because the same markers can be observed in some benign thyroid lesions, additional approaches are necessary to differentiate thyroid tumor subtypes, prevent overtreatment and tailor specific clinical management. This applies particularly to the recently described variant of thyroid cancer referred to as noninvasive follicular thyroid neoplasm with papillary‐like nuclear features (NIFTP). This variant has an estimated prevalence of 4.4% to 9.1% of all papillary thyroid carcinomas worldwide. We studied 60 thyroid lesions: 20 classical papillary thyroid carcinoma (CPTC), 20 follicular variant of PTC (FVPTC) and 20 NIFTP. We examined morphological and molecular features to identify parameters that can differentiate NIFTP from the other PTC subtypes. When blindly investigating the nuclear architecture of thyroid neoplasms, we observed that NIFTP has significantly longer telomeres than CPTC and FVPTC. Super‐resolved 3D‐structured illumination microscopy demonstrated that NIFTP is heterogeneous and that its nuclei contain more densely packed DNA and smaller interchromatin spaces than CPTC and FVPTC, a pattern that resembles normal thyroid tissue. These data are consistent with the observed indolent biological behavior and favorable prognosis associated with NIFTP, which lacks BRAFV600E mutations. Of note, next‐generation thyroid oncopanel sequencing was unable to distinguish the thyroid cancer histotypes in our study cohort. In summary, our data suggest that 3D nuclear architecture can be a powerful analytical tool to diagnose and guide clinical management of NIFTP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of CancerMême sujetThyroid Cancer Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207