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Enregistrement W4385604290 · doi:10.1101/2023.08.02.551672

Declines in ice cover induce light limitation in freshwater diatoms

2023· preprint· en· W4385604290 sur OpenAlexaff
Brittany N. Zepernick, Emily E. Chase, Elizabeth R Denison, Naomi E. Gilbert, Robbie M. Martin, Alexander R. Truchon, Thijs Frenken, William R. Cody, Justin D. Chaffin, George S. Bullerjahn, R. Michael L. McKay, Steven W. Wilhelm

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiatomWater columnOceanographyEnvironmental scienceBloomPhotic zoneSea iceEcologyLimnologyPhytoplanktonBiologyGeologyNutrient

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The rediscovery of diatom blooms embedded within and beneath Lake Erie ice cover (2007-2012) ignited an intense interest in psychrophilic adaptations and winter limnology. Subsequent studies determined ice plays a vital role in winter diatom ecophysiology, as diatoms partition to the underside of ice thereby fixing their location within the photic zone. Yet, climate change has led to widespread ice decline across the Great Lakes, with Lake Erie presenting a nearly ice-free state in several recent winters. It has been hypothesized the resultant turbid, isothermal water column will induce light limitation amongst winter diatoms, serving as a detrimental competitive disadvantage. Here, we conducted a physiochemical and metatranscriptomic survey of the winter Lake Erie water column (2019-2020) that spanned spatial, temporal, and climatic gradients to investigate this hypothesis. We determined ice-free conditions decreased diatom bloom magnitude and altered diatom community composition. Diatoms increased the expression of various photosynthetic genes and iron transporters, suggesting they are attempting to increase their quantity of photosystems and light-harvesting components (a well-defined indicator of light limitation). Notably, we identified two gene families which serve to increase diatom fitness in the turbid ice-free water column: proton-pumping rhodopsins (a second means of light-driven energy acquisition) and fasciclins (a means to “raft” together to increase buoyancy and co-locate to the surface to optimize light acquisition). With large-scale climatic changes already underway, our observations provide insight into how diatoms respond to the dynamic ice conditions of today and shed light on how they will fare in a climatically altered tomorrow.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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