MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4385625232 · doi:10.1101/2023.08.07.552264

Assemblies, synapse clustering and network topology interact with plasticity to explain structure-function relationships of the cortical connectome

2023· preprint· en· W4385625232 sur OpenAlexaff
András Ecker, Daniela Egas Santander, Marwan Abdellah, Jorge Blanco Alonso, Sirio Bolaños‐Puchet, Giuseppe Chindemi, Dhuruva Priyan Gowri Mariyappan, James B. Isbister, James King, Pramod Kumbhar, Ioannis Magkanaris, Eilif Müller, Michael Reimann

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Memory and Neural Computing
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesBoard of the Swiss Federal Institutes of TechnologyÉcole Polytechnique Fédérale de Lausanne
Mots-clésNeuroscienceSynaptic plasticityPlasticityMetaplasticityHomosynaptic plasticityNeuroplasticityConnectomeHomeostatic plasticityComputer scienceSynaptic scalingSynapseExcitatory postsynaptic potentialBiologyFunctional connectivityInhibitory postsynaptic potentialSynaptic augmentationPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Synaptic plasticity underlies the brain’s ability to learn and adapt. While experiments in brain slices have revealed mechanisms and protocols for the induction of plasticity between pairs of neurons, how these synaptic changes are coordinated in biological neuronal networks to ensure the emergence of learning remains poorly understood. Simulation and modeling have emerged as important tools to study learning in plastic networks, but have yet to achieve a scale that incorporates realistic network structure, active dendrites, and multi-synapse interactions, key determinants of synaptic plasticity. To rise to this challenge, we endowed an existing large-scale cortical network model, incorporating data-constrained dendritic processing and multi-synaptic connections, with a calcium-based model of functional plasticity that captures the diversity of excitatory connections extrapolated to in vivo -like conditions. This allowed us to study how dendrites and network structure interact with plasticity to shape stimulus representations at the microcircuit level. In our exploratory simulations, plasticity acted sparsely and specifically, firing rates and weight distributions remained stable without additional homeostatic mechanisms. At the circuit level, we found plasticity was driven by co-firing stimulus-evoked functional assemblies, spatial clustering of synapses on dendrites, and the topology of the network connectivity. As a result of the plastic changes, the network became more reliable with more stimulus-specific responses. We confirmed our testable predictions in the MICrONS datasets, an openly available electron microscopic reconstruction of a large volume of cortical tissue. Our results quantify at a large scale how the dendritic architecture and higher-order structure of cortical microcircuits play a central role in functional plasticity and provide a foundation for elucidating their role in learning.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetAdvanced Memory and Neural ComputingTravaux en français237 207