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Enregistrement W4385655638 · doi:10.1073/pnas.2211019120

Natural selection has driven the recurrent loss of an immunity gene that protects <i>Drosophila</i> against a major natural parasite

2023· article· en· W4385655638 sur OpenAlexfundno aff
Ramesh Arunkumar, Shuyu Olivia Zhou, Jonathan P. Day, Sherifat Bakare, Simone Pitton, Yexin Zhang, Chi-Yun Hsing, Sinéad O’Boyle, Juan Pascual‐Gil, Belinda Clark, Rachael J. Chandler, Alexandre B. Leitão, Francis M. Jiggins

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEuropean CommissionSight Research UKGovernment of CanadaGates Cambridge TrustUK Research and InnovationErasmus+Natural Environment Research CouncilEuropean Molecular Biology Organization
Mots-clésBiologyGeneDrosophila melanogasterAlleleNatural selectionGeneticsImmune systemImmunityParasite hostingGene expressionImmunologySelection (genetic algorithm)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polymorphisms in immunity genes can have large effects on susceptibility to infection. To understand the origins of this variation, we have investigated the genetic basis of resistance to the parasitoid wasp Leptopilina boulardi in Drosophila melanogaster. We found that increased expression of the gene lectin-24A after infection by parasitic wasps was associated with a faster cellular immune response and greatly increased rates of killing the parasite. lectin-24A encodes a protein that is strongly up-regulated in the fat body after infection and localizes to the surface of the parasite egg. In certain susceptible lines, a deletion upstream of the lectin-24A has largely abolished expression. Other mutations predicted to abolish the function of this gene have arisen recurrently in this gene, with multiple loss-of-expression alleles and premature stop codons segregating in natural populations. The frequency of these alleles varies greatly geographically, and in some southern African populations, natural selection has driven them near to fixation. We conclude that natural selection has favored the repeated loss of an important component of the immune system, suggesting that in some populations, a pleiotropic cost to lectin-24A expression outweighs the benefits of resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,607

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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