Cerebrospinal fluid proteins in idiopathic intracranial hypertension: An exploratory SWATH proteomics analysis
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: The pathogenesis of idiopathic intracranial hypertension (IIH) is currently poorly understood. This exploratory study aimed to identify potential cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers in IIH cases compared to controls using SWATH-MS proteomics approach. EXPERIMENTAL DESIGN: CSF samples were collected prospectively from IIH cases and control subjects which were subjected to SWATH-MS based untargeted proteomics. Proteins with fold change > 1.5 or < 0.67 and p-value < 0.05 were considered significantly differentially expressed. Data are available via ProteomeXchange with identifier PXD027751. Statistical analysis was conducted in R version 3.6.2. RESULTS: We included CSF samples from 33 subjects, consisting of 13 IIH cases and 20 controls. A total of 262 proteins were identified in Proteinpilot search. Through SWATH analysis, we quantified 232 proteins. We observed 37 differentially expressed proteins between the two groups with 24 upregulated and 13 downregulated proteins. There were two differential proteins among overweight versus non-overweight IIH cases. Network for 23 proteins was highly connected in the interaction analysis. CONCLUSIONS AND CLINICAL RELEVANCE: Neurosecretory, neuroendocrine, and inflammatory proteins were predominantly involved in causing IIH. This exploratory study served as a platform to identify 37 differentially expressed proteins in IIH and also showed significant differences between overweight and non-overweight IIH patients.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle